بهزاد ظهیر نژاد - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان
بهمن بهرام نژاد - استادیار گروه بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان
مونا نصری - دانشجوی کارشناسی ارشد جنگل داری دانشکده منابع طبیعی دانشگاه کردستان

موجودات زنده، شامل گیاهان معمولا در معرض پاتوژن های بی شماری در طبیعت قرار دارند. آن ها در پاسخ به حمله پاتوژن ها یک سیستم ایمنی ذاتی تکاملی توسعه داده اند. دفنسین های گیاهی پپنیدهای کوچک، بسیار پایدار و غنی از سیستئین هستند که بخشی از سیستم ایمنی ذاتی، که عمدتا در برابر پاتوژن های قارچی معطوف شده اند را تشکیل داده است. گیاهان تراریختی که بیش بیان دفنسین دارند در برابر پاتوژن های قارچی شدیدا مقاوم هستند. دفنسین های گیاهی به روشنی نشان دادند اگر چه توالی حفاظت شده محدود دارند اما هشت ریشه سیستئینی و یک گلایسین در جایگاه 34 کاملا حفظ شده دارند. همچنین در بیشتر موارد، گلایسین دوم (جایگاه 13) ، سرین(جایگاه 8) یک ریشه آروماتیک (جایگاه 11) و یک اسید گلوتامیک (جایگاه 29) حفظ شده دارند که از این مناطق می توان برای شناسایی ژن های دفنسین در گیاهان هم خانواده استفاده کرد. در این مطالعه توالی های EST ژن دفنسین گیاهان هم خانواده مانند سیب و هلو برای شناسایی ژن دفنسین در توت فرنگی مورد استفاده قرار گرفت. در نهایت سه گروه مجزا از ژن های دفنسین در توت فرنگی شناسایی شد که می توان از مناطق حفظ شده این گروه ها پرایمر طراحی نمود و ژن مورد نظر را برای بررسی بیشتر کلون کرد.

دفنسین های گیاهی، پپتیدهای کوچک، روش های بیوانفورماتیک