احسان پورعابد - بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
زهرا سادات شبر - بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران

برنج یکی از ارزشمندترین محصولات از لحاظ اقتصادی و اجتماعی است. خشکی نیز مهم ترین تنش و محدودیت برای کاهش پتانسیل عملکرد این گیاه می باشد. نظر به پیچیدگی و چند ژنی بودن تحمل به خشکی دراین تحقیق سعی شده است تا با گرد آوری تمامی ژن های شناخته شده دخیل در تحمل به خشکی در برنج، شبکه ژنی درگیر بازسازی شده و تصویر روشن تری از نحوه پاسخ دهی گیاه برنج به تنش خشکی و ژن های کلیدی مربوطه حاصل شود. در مجموع 133ژن شناسایی شد و شبکه برهم کنش پروتئینی برای آن ها رسم گردید. با استفاده از 12 الگوریتم محاسباتی Cytohubbaدر نرم افزار Cytoscape تمامی گره ها (Node) با بیشترین ارتباط (Edge) به دست آمد. این امر منجر به شناسایی 58 گره (ژن) غیر تکراری شد که به عنوان موثرترین ژن ها در این بین در نظر گرفته شده و شبکه ژنی مربوطه رسم شد. نتایج نشان داد که عوامل رونویسی بیشترین تعداد را در بین 58 ژن موثر داشتند. این امر نشان دهنده اهمیت این ژن ها درمکانیسم تحمل به خشکی می باشد. امید است نتایج به دست آمده در راستای یافتن راهکارهایی هدفمند جهت افزایش تحمل به خشکی مفید واقع گردد.

برنج، تنش خشکی، شبکه ژنی، Pathway Studio ، Cytoscape