خدیجه مظفری - بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
زهرا سادات شبر - بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران

تنش های غیرزیستی از مهم ترین عوامل محدودکننده عملکرد در گیاهان زراعی می باشند. خانواده ی ژنی( AP2/ERF)، گروه بزرگی از عوامل رونویسی مختص گیاهان هستند که درتنظیم بیان ژن های پاسخ دهنده به تنش های محیطی دخیل می باشند. بنابراین شناسایی و مطالعه ی این خانواده ی ژنی گامی موثر در راستای یافتن راهکارهایی هدفمند برای تحمل گیاهان به تنش ها خواهد بود. در این تحقیق برای شناسایی اعضای خانواده (AP2/ERF) در گندم (aestivum Triricum)، جستجو در پایگاه های اطلاعاتی مرتبط مانند plantTFDB ، EMBL ، NCBI ، GramineaTFDB ، TriFLDB ، GrainGenes انجام شد. در بانک اطلاعاتی NCBI ، جستجو و همردیف سازی با استفاده از ابزار tBLASN بر علیه داده های نوکلئوتیدی گندم با استفاده از توالی های پروتئینی حفاظت شده ی هرزیر خانواده AP2/ERF در گیاه آرابیدوپسیس تالیانا صورت گرفت. برای ترجمه ی توالی های فاقد پروتئین، از نرم افزارهای DNAstar و ORF finder استفاده شد. توالی ها توسط نرم افزار ClustalW همردیف شدند و درخت فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار MEGA 4 رسم شد. پس از بررسی توالی های پروتئینی و آنالیز فیلوژنتیکی ، 107 عضو از این خانواده درگندم شناسایی شد. 13 عضو در زیر خانواده ی AP2، ا44و 46 عضو به ترتیب در زیرخانواده های DREB و ERF، ا3 عضو در زیر خانواده RAV و تنها 1 عضو در زیرگروه Soloist قرار گرفتند.

گندم، عوامل رونویسی AP2/ERF، آنالیز های فیلوژنتیکی