بررسی بیوانفورماتیکی عملکرد ژن FT در گیاه توت فرنگی

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 649

This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0599

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

Abstract:

مهم ترین تغییر نموی در چرخه زندگی گیاهان شروع گلدهی می باشد. ژن Flowering Locus T یا FT(JN172098.1 accession number) یک پروتئین اتصال فسفاتیدیل اتانول آمین می باشد، که در شرایط طول روز بلند تحت تاثیر ژن CO در برگ ها فعال شده و پس از انتقال به مریستم انتهایی نقش کلیدی در تولید جوانه گل بازی می کند. انتقال این ژن به گیاهان باعث تسریع گلدهی شده است، بنابراین بررسی پروموتر این ژن با مقایسه Cis-element های موجود، جهت بالا بردن آگاهی و نحوه عملکرد آن حائز اهمیت می باشد. با بدست آوردن CDS ژن FT از NCBI حدود 1500 جفت باز از ناحیه پروموتری این ژن از سایت Phytozome گرفته شده و سپس آنالیز پروموتر با استفاده از دوسایت Plant CARE و PLACE انجام شد. نتایج نشان داد که حدود 14 مورد Cis-element پاسخ دهنده به نور و ریتم سیرکادین در این پروموتر مشاهده شد که بیانگر این است که به طور عمده عامل های رونویسی درگیر در مکانیسم های نوری به این نواحی Cis-element متصل می شوند. استفاده از این گونه پروموترها جهت استفاده در کاست های ژنی در بالا دست ژن های موثر در گلدهی، نه تنها در تسریع گلدهی بلکه در مطالعات فیزیولوژیک نیز حائز اهمیت می باشد.

Authors

مونا نصری

دانشجوی کارشناسی ارشد جنگل داری دانشکده منابع طبیعی دانشگاه کردستان

بهزاد ظهیر نژاد

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان

محمد صدیق کمانگر

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان

روژین مرادی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • Atanassov, A. Nenov and G. Dimov, 2005. Application of bioinformatics ...
  • M. L. Chiusano, 2005. ParPEST .A pipeline for EST data ...
  • نمایش کامل مراجع