بررسی بیوانفورماتیک ژن سوپر اکسیددیسموتاز در آرابیدوپسیس (Arabidopsisthaliana) و گیاه شورپسند Thellungiella halophyla
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 637
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0693
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
آنزیم سوپر اکسید دیسموتاز(SOD) نقش مهمی در برابر تنش های اکسیداتیو در گیاهان ایفا می کند. در حالیکه آرابیدوپسیس به عنوان یک گیاه مدل گلایکوفیت، برای تشریح مولکولی گیاهان شناخته شده است. گیاه شورپسند Thellungiella halophyla که شباهت زیادی به آرابیدوپسیس دارد، به عنوان یک مدل مناسب برای مطالع، پاسخ های مولکولی گیاهان به شوری در نظر گرفنه شده است. اطلاعات موجود نشان می دهد که درتنش شوری بیان ژن SOD در آرابیدوپسیس افزایش نمی یافت در حالیکه این ژن درT. halophyla به میزان زیادی افزایش بیان نشان می داد. این تحقیق با هدف مقایسه نواحی رمز شونده و پروموتور ژن SOD در دو گیاه آرابیدوپسیس و T. halophyla به منظور شناسایی تفاوت های احتمالی مرتبط با واکنش متفاوت آنها به شوری انجام شد. دو گیاه مورد بررسی ازنظر توالی آمینو اسیدی ژن SOD شباهت زیادی(95%) با یکدیگر داشتند. آنالیز پروموتور ژن SOD نشان داد که تعداد کل عناصر سپس در پروموتور ژن SOD آرابیدوپسیس 172 عنصر و در پروموتور ژنSOD گیاه T. halophyla 124 عنصر بود. آزمون آماری فیشر نشان داد که دو پروموتور از نظر تعداد عناصر عملگر سپس TATA-Box و CAAT-Box با هم اختلاف معنی داری دارند. همچنین عنصر MRE یکی از عناصر عملگر سپس موثر در پاسخ به تنش که محل اتصال عوامل رونویسی MYB می باشد، تنها در ناحیه پروموتوری ژن SOD در گیاه T. halophyla مشاهده شد. بنابراین شاید بتوان تفاوت بیان این ژن در دو گونه مورد بررسی را به برخی عناصر تنظیم کننده سپس موجود در پروموترها مرتبط دانست.
Keywords:
Authors
محمد باقر زاهدی
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
هومن راضی
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
روح الله شاملودشت پاگردی
دانشجوی دکتری اصلاح نباتات، بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :