بررسی توالی نواحی UTR ژنهای رمز کننده پمپ پروتونی غشای پلاسمائی در گیاهان
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,923
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0810
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
به منظور بررسی موتیف های موجود در ناحیه ی 5'-UTR ژنهای رمز کننده پمپ پروتونی غشای پلاسمانی، توالی نوکلئوتیدی این ژنها از 14 گیاه مختلف از Gene Bank گرفته شد . نواحی مذکور به وسیه ی نرم افزار minitab مورد تجزیه و تحلیل اماری قرار گرفتند . تعداد هر موتیف ، همبستگی بین موتیفهای مختلف و تاثیر نقش موتیف های بر همبستگی بین آنها بررسی شد . نتایج نشان دادند که در ناحیه ی 5'-UTR این ژنها موتیفهای مربوط به پاسخ به نور، الیستورهای قارچی ، جیبرلین، اکسین، بیان مربیستم، خشکی ، شرایط بی هوازی، سالیسیلیک اسید، بیان اندوسپرم و متیل جاسمونات وجود دارند و برخی از آنها جایگاه اتصال پروتئین های هستند . با بررسی نتایج مشخص شد که از بین 763 موتیف موجود 40 موتیف همبستگی کامل دارند که از این تعداد نیز 6 موتیف دارای نقش کاملا یکسان هستند . بین موتیف های ATCC-motif و ATCT-motif ، GT1-motif، Box II و TGACG-motif و CGTCA-motif همستگی کامل وجود داشت . این موتیف ها دارای نقش یکسانی می باشند به این صورت که دو گروه موتیف اول و دوم در پاسخ به نور و گروه موتیف سوم به متیل جاسمونات نقش دارند . بر اسسا نتایج حاصله می توان نتیجه گرفت که ناحیه ی 5'-UTR دارای نقش مهمی در کنترل بیان ژن های رمز کننده پمپ پروتوی و نقش این پمپ ها در فرآیندهای مختلف دارد .
Keywords:
ناحیه ی 5'-UTR پمپ پروتونی , موتیف
Authors
آیدا آزاد
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده علوم زراعی ، گروه بیوتکنولوژی واصلاح نباتات ساری شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی
مینا سیفایی
شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی ، بخش زراعت و اصلاح نباتات ۷۱۴۴۱۶۵۱۸۶
عباس عالم زاده
شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی ، بخش زراعت و اصلاح نباتات ۷۱۴۴۱۶۵۱۸۶
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :