بررسی توالی نواحی UTR ژنهای رمز کننده پمپ پروتونی غشای پلاسمائی در گیاهان

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,923

This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0810

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

Abstract:

به منظور بررسی موتیف های موجود در ناحیه ی 5'-UTR ژنهای رمز کننده پمپ پروتونی غشای پلاسمانی، توالی نوکلئوتیدی این ژنها از 14 گیاه مختلف از Gene Bank گرفته شد . نواحی مذکور به وسیه ی نرم افزار minitab مورد تجزیه و تحلیل اماری قرار گرفتند . تعداد هر موتیف ، همبستگی بین موتیفهای مختلف و تاثیر نقش موتیف های بر همبستگی بین آنها بررسی شد . نتایج نشان دادند که در ناحیه ی 5'-UTR این ژنها موتیفهای مربوط به پاسخ به نور، الیستورهای قارچی ، جیبرلین، اکسین، بیان مربیستم، خشکی ، شرایط بی هوازی، سالیسیلیک اسید، بیان اندوسپرم و متیل جاسمونات وجود دارند و برخی از آنها جایگاه اتصال پروتئین های هستند . با بررسی نتایج مشخص شد که از بین 763 موتیف موجود 40 موتیف همبستگی کامل دارند که از این تعداد نیز 6 موتیف دارای نقش کاملا یکسان هستند . بین موتیف های ATCC-motif و ATCT-motif ، GT1-motif، Box II و TGACG-motif و CGTCA-motif همستگی کامل وجود داشت . این موتیف ها دارای نقش یکسانی می باشند به این صورت که دو گروه موتیف اول و دوم در پاسخ به نور و گروه موتیف سوم به متیل جاسمونات نقش دارند . بر اسسا نتایج حاصله می توان نتیجه گرفت که ناحیه ی 5'-UTR دارای نقش مهمی در کنترل بیان ژن های رمز کننده پمپ پروتوی و نقش این پمپ ها در فرآیندهای مختلف دارد .

Keywords:

ناحیه ی 5'-UTR پمپ پروتونی , موتیف

Authors

آیدا آزاد

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده علوم زراعی ، گروه بیوتکنولوژی واصلاح نباتات ساری شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی

مینا سیفایی

شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی ، بخش زراعت و اصلاح نباتات ۷۱۴۴۱۶۵۱۸۶

عباس عالم زاده

شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی ، بخش زراعت و اصلاح نباتات ۷۱۴۴۱۶۵۱۸۶

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • Arango, M., Gevaudant, F., Oufattole, M., Boutry, M., 2003. The ...
  • Chen, K., Song, F., Calin, G.A., Wei, Q., Hao, X., ...
  • Chung, B. Y., Simons, C., Firth, A. E., Brown, C. ...
  • 'UTR introns on gene expression in Arabidopsis thaliana. BMC Genomics. ...
  • Huang, H. Y., Chien, C. H., Jen, K. H., Huang, ...
  • Michelet, B., Boutry, M., 1995. The plasma membrane q'-ATpase _ ...
  • Niu, X, Narasimhan, M., Salzman, R., 1993. NaCl regulation of ...
  • Oufattole, M., Arango, M., Boutry, M., 2000). Identification and expression ...
  • Vaughn, J. N., Ellingson, S. R., Mignone, F., Arnim, A. ...
  • نمایش کامل مراجع