آیدا آزاد - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده علوم زراعی ، گروه بیوتکنولوژی واصلاح نباتات ساری شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی
مینا سیفایی - شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی ، بخش زراعت و اصلاح نباتات ۷۱۴۴۱۶۵۱۸۶
عباس عالم زاده - شیراز، دانشگاه شیراز ، دانشکده کشاورزی ، بخش زراعت و اصلاح نباتات ۷۱۴۴۱۶۵۱۸۶

به منظور بررسی موتیف های موجود در ناحیه ی 5'-UTR ژنهای رمز کننده پمپ پروتونی غشای پلاسمانی، توالی نوکلئوتیدی این ژنها از 14 گیاه مختلف از Gene Bank گرفته شد . نواحی مذکور به وسیه ی نرم افزار minitab مورد تجزیه و تحلیل اماری قرار گرفتند . تعداد هر موتیف ، همبستگی بین موتیفهای مختلف و تاثیر نقش موتیف های بر همبستگی بین آنها بررسی شد . نتایج نشان دادند که در ناحیه ی 5'-UTR این ژنها موتیفهای مربوط به پاسخ به نور، الیستورهای قارچی ، جیبرلین، اکسین، بیان مربیستم، خشکی ، شرایط بی هوازی، سالیسیلیک اسید، بیان اندوسپرم و متیل جاسمونات وجود دارند و برخی از آنها جایگاه اتصال پروتئین های هستند . با بررسی نتایج مشخص شد که از بین 763 موتیف موجود 40 موتیف همبستگی کامل دارند که از این تعداد نیز 6 موتیف دارای نقش کاملا یکسان هستند . بین موتیف های ATCC-motif و ATCT-motif ، GT1-motif، Box II و TGACG-motif و CGTCA-motif همستگی کامل وجود داشت . این موتیف ها دارای نقش یکسانی می باشند به این صورت که دو گروه موتیف اول و دوم در پاسخ به نور و گروه موتیف سوم به متیل جاسمونات نقش دارند . بر اسسا نتایج حاصله می توان نتیجه گرفت که ناحیه ی 5'-UTR دارای نقش مهمی در کنترل بیان ژن های رمز کننده پمپ پروتوی و نقش این پمپ ها در فرآیندهای مختلف دارد .

ناحیه ی 5'-UTR پمپ پروتونی، موتیف