مقایسه مولکولی میگوی ببری سبس semisulcatusPenaeus و زیر گونه آن Penaeus semisulcatus persicus بااستفاده از ناحیه S rRNA-tRNAval میتوکندری

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 459

متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0855

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

Abstract:

نشانگرهای میتوکندریایی در سطح وسیعی جهت مطالعه ژنتیک جمعیت و روابط فیلوژنتیکی میان آبزاین مورد استفاده قرار می گیرند . یکی از نشانگرهای میتوکندریایی که اخیرا مورد توجه قرار گرفته ،ناحیه 16SrRNA/tRNA val است . بر اساس مطالات مورفولوژک ، زیر گونه جدیدی از میگوی ببری سبز (Penaeus semisulcatus) با نام Penaeussemisulcatus persicus معرفی شده است . لذا مقایسه مولکولی میان گونه و زیر گونه فوق با استفاده از ناحیه 16SrRNA/tRNAval مورد توجه قرار گرفت . لذا 3 نمونه از گونه و 3 نمونه از زیر گونه از سواحل بوشهر جمع آوری و DNA ژنومی استخراج شده از ماهیجه ی بدنی آن ها به عنوان الگو استفاده شد . ناحیه مذکور با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و از هر دو طرف تعیین توالی شد . همردیفی و فاصله ژنتیکی توالی ها با استفاده از نرم افزارهای ClustalW و MEGA 5.1 بررسی و محاسبه شد . نتایج حاصل از تعیین توالینشان داد که طول قطعات 522 تا 524 جفت باز و غنی از AT اهستند . نتایج هم ردیفی نشان داد که به استثنای نمونه Per4 همه نمونه های د رگونه و زیر گونه بیشا ز 99% با همدیگر مطابقت دارند . فاصله زنتیکی Per4 با سایر نمونه های از 0.074 تا 0.079 است . این نتیجه حاکی از آن است که ناحیه 16S rRNA/tRNAval میتوکندریایی نیز مانند COI ، تفاوت ژنتیکی قابل میان گونه و زیرگونه مذکور ندارد . تفاوت ژنتیکی قابل توجه میان Per4 با سایر نمونه های ،اختتمالا به دلیل تجمع جهش های غیر مضر طی نسل های متوالی در این ناحیه از میتوکندری است .

Authors

مریم سپرهم

دانشجوی کارشناسی ارشد علوم سلولی و مولکولی دانشگاه خلیج فارس بوشهر

سیدجواد حسینی

استادیار گروه علوم سلولی و مولکولی و بیوتکنولوژی دانشگاه خلیج فارس

صدیقه هاشم نیا

استادیار گروه شیمی دانشگاه خلیج فارس بوشهر

احسان زارعی

دانشجوی کارشناسی ارشد علوم سلولی و مولکولی دانشگاه خلیج فارس بوشهر

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • Baldwin , J.D., Bass , A.L., Bowen, B.W., Clark, W.H., ...
  • -Bouchon, D., Souty -Grosset, C., Raimond, R., 1994 .Mitochondril DNA ...
  • Brandfass, C., Karlovsky, P, 2008. Upscaled CTAB- based DNA extraction ...
  • Pilar Calo-Mata a, Ananias Pascoal a, Inmaculada Fernandez- No a, ...
  • Liu, Z...Cordes, J.F., 2004. _ marker technological and their applications ...
  • Rahnama, R., Hosseini, S. j., Qasemi, S. A., Yavari, V., ...
  • Rahnama, R., Hosseini, S. j., Qasemi, S. A., Yavari, V., ...
  • Tong , J .G. _ Chan, T.Y., Chu, K.H., 2000. ...
  • Tsoi, K. H., Wang, Z.K and Chu, K. H..2005. "Genetic ...
  • Tsoi, K., Chan, T and Chu, K..207. "Molecular population structure ...
  • نمایش کامل مراجع