بررسی بیوانفورماتیکی خصوصیات بیوشیمیایی برخی ایزوفرم های آنزیم آسکوربات پراکسیداز

تنشهای غیر زیستی شکلگیری ترکیبات رادیکالهای آزاد اکسیژن را در بافتهای گیاهی تحریک می کند . این ترکیبات آسیب زیادی به سیستم فتوسنتز در گیاه وارد می نمایند . گیاهان برای رشد طبیعی خود و مقابله با اثرات مخرب این ترکیبات از سیستم سمزدایی توسط آنتیا کسیدانتها استفاده می کنند . در میان مکانیسمهای آنتیا کسیدانت ، سمزادیی آنزیم آسکورباتپراکسیداز نقشی مهم در حفاظت از گیاه در برابر آسیبهای اکسیداتیو ایفا می کند . ایزوفرمهای مختلف سیتوسولی ، کلروپلاستی (استرومایی یا تیلاکوتیدی ) پراکسی زومی و میتوکندریایی این آنزیم که نقش عمده ی سمزدایی ROS را در اجزای مختلف سلولی بر عهده دارند و از نظر PHاپتیمم ، پایداری ،اتصال اختصاصی به غشا و میزان پاسخ به تنش باهم تفاوت دراند . برخیاز خصوصیات فیزیکوشیمیایی ایزوفرمهای مختلف این آنزیم در گیاهان مختلف بررسی شد . ابتدا توالیهای ایزوفرمهای مختلف آنزیم از پایگاه Uniprot جمع آوری شد و با نرم افزار Clustalw مقایسه شدند . آنالیزهای بعدی و محاسبه ی برخی از خصوصیات فیزیکوشیمیایی پروتئین با نرم افزار Protparam نشان داد با وجود اینکه در ایزوفرمهای مختلف این آنزیم اسید آمینه های شرکت کننده در جایگاه فعال و یا واکنش الکتروستاتیک با سوبسترا در تمام گیاهان بسیار محافظت شده می باشد اما این آنزیم ها در ویژگی هایی مانند ضریب پایداری ، مقاومت در برابر حرارت و pI متافوت می باشند و برخی از ایزوفرمها به دلیل حضورشان در اندامکهایی که میزان تولید ROS بیشتر است پایدارتر و نیمه ی عمر بالاتری دارند .

Keywords:

آسکوربات , پراکسیدازف گونه های اکسیژن فعال (ROS)