مشخصات مولکولی ژنوم کامل جذایه ایرانی ویروس بی بذری گوجه فزنگی
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 540
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0959
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
اخیرا ویروس بیبذری گوجه فرنگی از گیاهان زینتی از استان کرمان گزارش گردیده است . به منظور مطالعه و بررسی مولکولی ژنوم کامل جدایه ایرانی ویروس بی بذری گوجه فرنگی بک نمونه گیاه اطلسی آلوده به این ویروس در منطقه ماهان کرمان جمع آوری و آلودگی نسبت به TAV توسط آزمون DAS-ELISA تایید گردید . آر . ان .ای این جدایه استخراج و با استفاده از سیزده جفت آغازگر اختصاصی طولکامل ژنوم این جدایه در روش RT-PCR تکثیر و سپس در پلاسمید pTZ57R/T در دو سویه JM 107 باکتری Escherichia coli همسانه سازی گردید . بر اساس نتایج حاصل طول قطعات RNA-1، RNA-2 و RNA-3 جدایه ایرانی TAV ( Ker.Mah.P) به ترتیب 3357، 3035، 2192 و طول کامل ژنوم این جدایه معادل 8587 نوکلئوتید بدست آمد . زنوم این جدایه حاوی پنج قاب باز خواندنی شامل CP، MP ، 2a ، 2b، 1aمی باشد . موتیف های حفاظت شده ناحیه هلیکاز و نواحی حفاظت شده RdRp به ترتیب بر روی قطعات RNA-1 و RNA-2 قرار دارند . همچنین نواحی حفاظت شده UG tractو نایحه بین زنی (IR) نیز بر روی قطعه RNA-3 قرار دارد . در انتهای 3'UTR تمامی آر . ان . ای های جدایه مذکور نیز یک توالی حفاظت شده به طول 40 نوکلئوتید وجود دارد . علاوه بر این ژن 2b جدایه Ker.Mah.P نیز به طول 315 نوکلئوتید بوده که دارای 27 نوکلئوتید بیش تر از سایر جدایه های گزارش شده TAV در دنیا می باشد . نتایج خاصل از این تحقیق بیانگر آنست که ژنوم جدایه ایرانی ویروس TAV همانند سایر جدایه های این ویروس در دنیا دارای نواحی حفاظت شده می باشد .
Keywords:
Authors
محمد مداحیان
گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه شهید باهنر کرمان
حسین معصومی
گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه شهید باهنر کرمان
جهانگیر حیدرنژاد
گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه شهید باهنر کرمان
اکبر حسینی پور
گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه شهید باهنر کرمان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :