مقایسه عملکرد زبان برنامه نویسی C با FORTRAN برای مطابقت رشته های DNA با رابط موازی سازی OpenMP
Publish place: International Conference on
Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,216
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICESAL01_167
تاریخ نمایه سازی: 22 مهر 1394
Abstract:
در این مقاله سعی داریم, تا با استفاده از یک الگوریتم موازی به نام کامبت که زاتا یک الگوریتم سریال است را به نحوه که در ادامه به شرح آن می پردازیم، قسمتی های از الگوریتم را به صورت موازی با رابط موازی سازیOpenMP پیاده سازی کنیم, تا با استفاده از آن در سطح DNA پروتئین برای مطابقت رشته DNA در ناحیه کد , دو زبان برنامه نویسی FORTRAN و C را با رابط موازی سازی OpenMP مورد مقایسه قرار دهیم. اما هدف از ارائه این مقاله این است, که کدام یک زمان کمتری را برای مطابقت دو رشتهDNA ناحیه کد در سطح پروتئین ارائه می دهد.در حالی زمان اجرای برنامه در هر دو زبان با تعداد پردازنده ای متفاوت مورد بررسی قرار میگردند، تا در پایان این مقاله به هدف اصلی مورد نظرمان که، از کدام یک از این دو زبان در آزمایشات آینده برای مطابقت دو رشته DNA استفاده نماییم.
Keywords:
زبان برنامه نویسیC / OpenMP , FORTRAN/مطابقت رشته DNA
Authors
میلاد قاسمزاده
دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
عبدالرضا سوادی
استادیار دانشگاه فردوسی - مشهد
محمدزکی خاوری
دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
امیررضا تقدیسی
دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :