بررسی فیلوژنیک گونه های خانواده Penaeidae به روش تعیین توالی ژن mt-DNA در آب های شمالی خلیج فارس

به منظور مطالعه فیلوژنتیکی میگوهای خانواده Penaeidae سواحل بحرکان ، از روش تعیین توالی ژن 16S rRNA استفاده شد. استخراج DNA از عضله پای شنا میگوها باروش CTAB انجام شد. قطعه ژنی 16S rRNA با استفاده از آغازگرهای جهانی 16Sar/16Sbr تکثیر گردید. گرچه بعد از نمونه برداری میگوی Metapenaeus sp. به عنوان گونه M. affinisشناسایی و جداسازی شد ولی Blast نتایج حاصل از تعیین توالی ژن 16S rRNA نشان داد که توالی مورد نظر به طور کامل با ژن 16S rRNA گونه M. monoceros منطبق می باشد. همچنین آنالیزهای بیشتر با استفاده از نرم افزار MEGA Ver. 5 نتیجه به دست آمده را تایید کرد. نتایج حاصل از هم ردیفی توالی های M. monoceros با استفاده از نرم افزارClustal W نشان دهنده 17 مکان پلی مورفیسم بود که از این تعداد 10 مکان پارسیمونی تشخیص داده شدند. نتایج هم ردیفی توالی 16S rRNA گونه P. stylifera، 14 مکان پلی مورف و 4مکان پارسیمونی را نشان داد. نتایج حاصل از نرم افزار Arlequin Ver 3 تنوع هاپلوتیپی را برابر 1 نشان داد. این توالی ها غنی از تیمین و ادنین (64/2 درصد) بودند. میزان شاخص R،1/418 و میانگین واگرایی این دو گونه از هم 10/9 درصد محاسبه شد. براساس نرخ موتاسیون دو درصد به ازای هر میلیون سال برای mtDNA زمان اشتقاق این دو گونه از هم پنج میلیون و چهار صد و پنجاه هزار سال پیش تخمین زده شد.

Keywords:

خلیج فارس , فیلوژنتیک , پنائیده , تعیین توالی , 16S rRNA