تهیه نقشه لینکاژی نشانگرهای SSR و مکان یابی QTLهای کنترل کننده زمان رسیدگی در یک جمعیت F2 برنج
Publish place: 04th National Biotechnology Congress of Iran
Publish Year: 1384
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 3,064
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI04_278
تاریخ نمایه سازی: 30 دی 1386
Abstract:
تهیه نقشه های مولکولی و شناسایی نواحی ژنومی کنترل کننده صفات کمی اهمیت زیادی برای به نژاد گرایان برنج دارد به طوریکه با علم به موضوع با دقت بیشتر و در مدت زمان کمتری می توان از طریق اجرای برنامه های انتخاب به کمک نشانگر به اصلاح این گونه صفات پرداخت. با توجه به بارندگی های زمان برداشت در نواحی شمال ایران و خسارات بسیار زیادی که در این مرحله به محصول وارد می شود و باعث کاهش کیفیت و قیمت آن می گردد، اهمیت مطالعه زمان رسیدگی به منظور کاهش آن بر کسی پوشیده نیست. در این مطالعه، نقشه ژنتیکی نشانگرهای ریز ماهواره (SSR) و نواحی ژنومی کنترل کننده زمان رسیدگی در برنج در یک جمعیت F2 حاصل از تلاقی گرده دم سفید مکان یابی شدند. 192 گیاه F2 حاصل از تلاقی فوق به همراه هر دو والد در موسسه نحقیقات برنج کشور (رشت) کشت و برای زمان رسیدگی مورد اندازه گیری قرار گرفتند. DNA ژنومی از برگهای تازه و جوان والدین و گیاهان F2 استخراج و از نظر 88 نشانگر SSR تعیین ژنوتیپ شدند. نقشه لینکاژی حاصل (با حداکثر نوترکیبی 0/3 و LOD≤ 5)، 1367/9 سانتی مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد و فاصله متوسط نشانگرها از یکدیگر 18 سانتی مورگان بود. برای شناسایی نواحی ژنومی کنترل کننده زمان رسیدگی از دو روش تجزیه QTL استفاده گردید. ابتدا مکان یابی فاصله ای (LOD≤ 3) مورد استفاده قرار گرفت و سپس از مکان یابی فاصله ای مرکب (CIM) برای تأیید QTLهای شناسایی شده استفاده گردید. در مجموع 5 QTL شناسایی گردید که بر روی کروموزوم های 2،3،5،6 و 8 قرار داشتند. از 5 QTL فوق دو کیو تی ال (md6 و md8)، که بر روی کروموزوم های 6 (در فاصله RM121-RM527) و 8 (در فاصله MR38-MR25) مکان یابی شدند، بزرگ اثر بودند و با LOD=5.82 و LOD=6.57 به ترتیب 27/9% و 32/6% از تنوع فونوتیپی زمان رسیدگی را کنترل می کردند. اثر افزایشی QTLها از 1/41 تا 4/54 روز متغیر بود. الل های گرده باعث افزایش زمان رسیدگی در QTLهای md2 و md3 و md8 (با میانگین 3 روز در هر QTL ) شدند، در حالی که در دو QTL دیگر (md5 و md6) الل های دم سفید با متوسط 2/74 روز در هر QTL زمان رسیدگی را کاهش دادند. نوع عمل ژن در QTL های شناسایی شده از افزایشی تا فوق غالبیت متغیر بوده و به استثنای md3 و md8 که در آنها غالبیت به سمت افزایش زمان رسیدگی بود، در سایر QTLها اثر غالبیت ژنها برای کاهش زمان رسیدگی مشاهده گردید.
Keywords:
برنج , زمان رسیدگی , نشانگرهای SSR , نقشه لینکاژی , تجزیه QTL , مکان یابی فاصله ای , مکان یابی فاصله ای مرکب (CIM)
Authors
بابک ربیعی
عضو هیئت علمی دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت
بهزاد قره یاضی
عضو هیئت علمی موسسه تحقیقات بیوتکنولوژی کشاورزی
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :