بررسی روابط بین زیرگونه Mus با استفاده از توالی D-loop ناحیه ژنوم میتوکندریایی mtDNA

Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 539

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NCER04_113

تاریخ نمایه سازی: 19 اردیبهشت 1395

Abstract:

در این بررسی از 1330 توالی D-loop استفاده شد. که از بانک ژن NCBI استخراج شد. این توالی ها مربوط به سه زیر گونه از موش خانگی هستند . این کمپلکس شامل سه زیر گونه (216 توالی D-loop مربوط به زیر گونه M.m.musculus و 820 توالی D-loop مربوط به زیر گونه M.m.domesticus و 304 توای مربوط به زیرگونه M.m.castaneus می باشد) سپس توالی های نوکلئوتیدی هر زیر گونه توسط نرم افزار های Mega6 و Arlequin و dnaSP انالیز شدند. همچنین فرکانس هر یک از نوکلئوتید ها ، میزان تغییرات پورین ها، میزان تغییرات پیریمیدین ها محاسبه شد. همچنین با استفاده از نرم افزار مگا مدل تکاملی مناسب انتخاب گردید و درخت فیلوژنتیکی مناسب نیز رسم گردید. هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیک فلوژنی و فیلوژئوگرافی گونه Mus با استفاده از ژنوم میتوکندری (mtDNA) می باشد. همچنین در بانک ژنی NCBI تعدادی از توالی ها مربوط به یک زیر گونه اند در حالی که طبق بررسی ها و انالیز های انجام شده این توالی ها مربوط به یک زیر گونه دیگر است.این بررسی زیر گونه M.m.musculus را به عنوان زیر گونه اجدادی به ما معرفی می کند و دو زیرگونه دیگر نیز از این زیر گونه اشتقاق یافته اند.

Authors

فرید فیضی باقل آباد

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوسیستماتیک جانوری،گروه علوم جانوری،دانشکده علوم زیستی،دانشگاه شهیدبهشتی تهران

حسن رجبی مهام

استاد گروه علوم جانوری،دانشکده علوم زیستی،دانشگاه شهید بهشتی تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Bonhomme, F., Orth, A., Cucchi, T., Raj abi-Maham, H., Catalan, ...
  • Boursot, P., Auffray, J.-C., Britton-D avidian, J., & Bonomme, F. ...
  • Guenet, J.-L., & Bonhomme, F. (2003). Wild mice: an ever ...
  • GUnddz, i, Tez, C., Malikov, V., Vaziri, A., Polyakov, A. ...
  • Hall, T. A. (1999). BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment ...
  • Macholan, M., Baird, S. J., Dufkova, P., Munclinger, P. Bimova, ...
  • Siahsarvie, R., AUFFRAY, J. C., Darvish, J., RAJABI -MAHAM, H., ...
  • Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei , ...
  • نمایش کامل مراجع