CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی روابط بین زیرگونه Mus با استفاده از توالی D-loop ناحیه ژنوم میتوکندریایی mtDNA

عنوان مقاله: بررسی روابط بین زیرگونه Mus با استفاده از توالی D-loop ناحیه ژنوم میتوکندریایی mtDNA
شناسه ملی مقاله: NCER04_113
منتشر شده در اولین همایش بین المللی و چهارمین همایش ملی پژوهش های محیط زیست و کشاورزی ایران در سال 1394
مشخصات نویسندگان مقاله:

فرید فیضی باقل آباد - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوسیستماتیک جانوری،گروه علوم جانوری،دانشکده علوم زیستی،دانشگاه شهیدبهشتی تهران
حسن رجبی مهام - استاد گروه علوم جانوری،دانشکده علوم زیستی،دانشگاه شهید بهشتی تهران

خلاصه مقاله:
در این بررسی از 1330 توالی D-loop استفاده شد. که از بانک ژن NCBI استخراج شد. این توالی ها مربوط به سه زیر گونه از موش خانگی هستند . این کمپلکس شامل سه زیر گونه (216 توالی D-loop مربوط به زیر گونه M.m.musculus و 820 توالی D-loop مربوط به زیر گونه M.m.domesticus و 304 توای مربوط به زیرگونه M.m.castaneus می باشد) سپس توالی های نوکلئوتیدی هر زیر گونه توسط نرم افزار های Mega6 و Arlequin و dnaSP انالیز شدند. همچنین فرکانس هر یک از نوکلئوتید ها ، میزان تغییرات پورین ها، میزان تغییرات پیریمیدین ها محاسبه شد. همچنین با استفاده از نرم افزار مگا مدل تکاملی مناسب انتخاب گردید و درخت فیلوژنتیکی مناسب نیز رسم گردید. هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیک فلوژنی و فیلوژئوگرافی گونه Mus با استفاده از ژنوم میتوکندری (mtDNA) می باشد. همچنین در بانک ژنی NCBI تعدادی از توالی ها مربوط به یک زیر گونه اند در حالی که طبق بررسی ها و انالیز های انجام شده این توالی ها مربوط به یک زیر گونه دیگر است.این بررسی زیر گونه M.m.musculus را به عنوان زیر گونه اجدادی به ما معرفی می کند و دو زیرگونه دیگر نیز از این زیر گونه اشتقاق یافته اند.

کلمات کلیدی:
، M.m.castaneus ، M.m.musculus ، mtDNA ، D-loopM.m.domesticus

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/461773/