ارائه روشی نوین جهت تخمین مقادیر گمشده در ریزآرایه‌های DNA با استفاده از خوشه‌بندی GO
Publish place: 13th Iranian conference on Biomedical Engineering
Publish Year: 1385
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,358
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICBME13_073
تاریخ نمایه سازی: 31 خرداد 1387
Abstract:
معمولا داده های زیر آرایه DNA شامل مقادیر گمشده هستند. تخمین مقادیر گمشده پیش از تحلیل داده های ریزآرایه به دو دلیل اهمیت ویژه ای برخوردار است. اولا روش های تحلیل به دادگان کاملی به عنوان ورودی نیاز دارند. ثانیا خروجی این روش ها به شدت تحت تاثیر کیفیت روش های تخمین می باشد. روش های معمول تخمین مقادیر گمشده، فقط از همبستگیهای آماری در فرآیند تخمین استفاده می کنند در حالیکه در روش پیشنهادی از اطلاعات زیست شناختی مربوط به ژن ها استفاده می شود. روش پیشنهادی از دو بخش تشکیل شده است: ابتدا ژنهای مشابه از طریق خوشه بندی GO انتخاب می شوند. سپس مقادیر گمشده با ترکیب خطی ژنهای مشابه تخمین زده می شوند. نتایج پیاده سازی بر روی دادگان مخمرنان (Yeast) نشان می دهد که اولا روش پیشنهادی نسبت به روش های تخمین (k-nearest neighbor (KNN عملکردی بهتر یا قابل مقایسه دارد. ثانیا به تعیین پارامتر K که نشان دهنده ژن های مشابه با ژن حاوی مقادیر گمشده است، نیازی ندارد.
Keywords:
ریز آرایه DNA , بیان ژن , اُنتولوژی ژن(GO) , تخمین (k-nearest neighbor (KNN , تخمین (local least squares(LLS
Authors
سیده فاطمه مولائی زاده
دانشگاه صنعتی امیرکبیر، دانشکده مهندسی پزشکی
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :