تصحیح کمترین خطا در بازسازی هاپلوتایپ با یک الگوریتم سریع
Publish place: 14th Iranian conference on Biomedical Engineering
Publish Year: 1386
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,498
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICBME14_044
تاریخ نمایه سازی: 3 تیر 1387
Abstract:
یکی از مدلهای مهم مساله بازسازی هاپلوتایپ تصحیح کمترین غلط می باشد. این مدل با تصحیح کمترین غلط ممکن در قطعات ژنوم ورودی، جفت هاپلوتایپ را بازسازی می نماید. با توجه به این که این مساله جزء مسائل غیر قطعی سخت (NP-Hard) می باشد، الگوریتهای قبلی ارائه شده با دو مشکل هزینه زیاد زمان اجراء و عدم جواب قطعی روبرو هستند. در این مقاله برای حل این مساله یک الگوریتم شاخه و قید ارائه شده است که با استفاده از یک تابع هرس جدید میتواند مساله را در یک زمان مناسب بطور دقیق اجرا نماید. این الگوریتم بر روی یک مجموعه داده اجرا شده و زمان اجرای آن کارا بودن آن را نشان می دهد.
Keywords:
Authors
مهدی صادقی
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری ، تهران
هایده اهرابیان
گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر ، دانشگاه ته
عباس نوذری
گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر ، دانشگاه ته
جواد محمدزاده
گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر ، دانشگاه ته
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :