پیش بینی چسبندگی پپتیدها به مولکول HLA-A*0201 با استفاده از شبکه های عصبی مصنوعی

پپتیدهایی که همراه مولکول‌های MHC ارائه می شوند، اهمیت زیادی در شناسایی آنتی ژن توسط سلول های T دارند. مشخص شدن توالی اسید های آمینه این اپی توپ ها ارزش بسیاری در ساخت واکسن دارد. شناخت اپی توپ ها به کمک روش های آزمایشگاهی مستلزم صرف وقت زیاد و هزینه گزاف است. از این رو اخیراً استافده از روش های نرم افزاری مورد توجه محققان قرار گرفته است تا به کمک آنها تعداد پپتیدهایی که باید مورد آزمایش قرار گیرند، کاهش یابد. در این مقاله با کاربرد شبکه های عصبی مصنوعی کوشش شده است ابزاری مناسب برای شناسایی اپی توپ ها ارائه نمود. با استفاده از دو شبکه پرسپترون دو لایه نشان داده شده است که می توان دقت بالایی در پیش بینی اپی توپ های کلاس HLA-A*0201 به دست آورد. حساسیت شبکه ها از 91% تا 92% و اختصاصیت آنها از 79% تا 82% بوده است. با توجه به این که در تحقیقات گذشته دقت های ارائه شده به ندرت از 80% بیشتر شده‌اند، دستیابی به این سطوح دقت قابل توجه است.