مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه های قارچ Fusarium verticillioides عامل بیماری پوسیدگی ریشه برنج با استفاده از نشانگر SSR

بیماری پوسیدگی ریشه ناشی از Fusarium verticillioides یکی از مهم ترین بیماری های برنج در ایلام است. برای تعیین تنوع ژنتیکی بیمارگر در شالیزارهای استان ایلام، تعداد 56 نمونه آلوده از مزارع شهرستان های مختلف جمع آوری شد. پس از کشت، خالص سازی و شناسایی جدایه ها، آزمون مولکولی با استفاده از پنج جفت آغازگر ریزماهواره انجام گرفت. از آغازگرهای ریزماهواره26آلل در جدایه ها تکثیر شد. میانگین تعداد آلل در هر جایگاه5/2 است، بیشترین تعداد به میزان40آلل در جایگاه های ژنی 5H08و5H09 و کمترین تعداد به میزان 24 در جایگاه 5H12 مشاهده شد شاخص چندشکلی نشانگرها در آغازگر 5H07با 0/37 بیشترین و آغازگر 4H18با0/14 کمترین مقدار را دارا بودند. توزیع مقادیر PIC به طور میانگین برای کل نشانگرها 0/25 بود. براساس دندروگرام در سطح تشابه8 درصد جدایه ها در 10 گروه قرار گرفتند. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که98 درصد از تنوع ژنتیکی در بین کلیه جدایه ها و تنها 2 درصد آن به مناطق مختلف جغرافیایی اختصاص دارد بنابراین بین جدایه ها از مناطق مختلف شباهت ژنتیکی زیادی وجود داشت. شباهت ژنتیکی بالا را می توان به مهاجرت ژن یا ژنوتیپ در اثر عوامل مختلف نسبت داد

Keywords:

برنج , تنوع ژنتیکی SSR , Fusarium verticillioides