گروه بندی ژنتیکی گاومیشهای بومی آذری و شمالی با روش شبکه عصبی SVM
Publish place: IRANIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE، Vol: 47، Issue: 2
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 503
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAS-47-2_011
تاریخ نمایه سازی: 8 خرداد 1396
Abstract:
هدف این تحقیق گروه بندی گاومیش های استانهای آذربایجان شرقی، غربی و اردبیل از بوم جور)اکوتیپ( آذری و استان گیلان از بوم جور شمالی و درنهایت قابلیت جداسازی افراد مناطق مختلف با روش یادگیری ماشین بود. به شمار 252 گاومیش از مناطق مختلف دو بوم جور شمالیو آذری نمونه گیری شد و با استفاده از SNPChip 90K مربوط به شرکت افی متریکس در کشور ایتالیا تعیین ژنوتیپ شد. برای پیش بینی عملکرد روش ماشین بردار پشتیبان برای گروه بندی افراد،دو روش متریک اعتبارسنجی متقابل و سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد سامانه ) AUC ( اعمال شد. نتایج آزمون اعتبارسنجی متقابل و سطح زیر منحنی برای گروه بندی افراد چهار منطقه بهترتیب 32 و 39 درصد بود که گویای این است که باوجود نزدیک بودن افراد گله های مختلف و سخت بودن جداسازی این افراد، روش ماشین بردار پشتیبان با درستی بالایی، توانایی اختصاصدادن افراد به گلههای مربوط به خود را دارد. نتایج آزمونهای اعتبارسنجی متقابل و سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد سامانه برای دو بوم جور به ترتیب برابر 39 و 32 درصد بود که نشان دهنده قابلیتجداسازی بهتر دو بوم جور است. روش یادگیری ماشین با توجه به این موارد و با پیش بینی هایی که برای گروه بندی هر فرد انجام میدهد میتواند در کنترل کیفیت و کاربردهای ژنتیکی کارآمد باشد.
Keywords:
Authors
زهرا عزیزی
دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
حسین مرادی شهربابک
استادیارگروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج
محمد مرادی شهربابک
استادگروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج
عباس رافت
دانشیارگروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز