شناسایی، همسانه سازی وتعیین توالی ژن MT ND2در مرغهای بومی خراسان

میتوکندری مسیول تولید 90درصد از انرژی مورد نیاز سلول می باشد. مقداری از تفاوت ها درعملکرد رشد جوجه های گوشتی و بیان فنوتیپی راندمان غذایی ممکن است مربوط به اختلاف درراندمان عملکرد میتوکندری باشد. این پژوهش بمنظور همسانه سازی و تحلیل مرغان بومیخراسان با تاکید بر ژن ND2 به منظور بررسی جهش های احتمالی است. بدین منظور از نمونهخون مرغ بومی خراسان، DNA ژنومی استخراج گردید و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی اینژن، واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت تکثیر ژن انجام شد، محصول واکنش بر روی ژل آگارزالکتروفورز شد. باندهای حاصل با استفاده از ناقل خطی pTZ57R/T در باکتری E. coli همسانه-سازی و توالی یابی شد. مقایسه نوکلیوتیدی قطعه توالییابی شده با ژنوم مرجع چهار جهش را نشانداد و شباهت %99در %100طول خود با توالی کامل ژنوم میتوکندری Gallus gallus در توالی-های ثبت شده میتوکندری طیور با شماره دسترسی X52392.1(ژنوم مرجع)، ،GU261709.1 نشان داد. مقایسهAY235571.1 وHQ857210.1 ،KF826490.1 ،AP006746.1 ،GU261712.1پروتیینی نشان دهنده شباهت توالی حاصل با توالی های پروتیینی مربوط به ژن ND2 میتوکندریطیور در بانک اطلاعاتی بود به گونه ای که بیشترین شباهت، %100در %100طول خود متعلق بهژن ND2در Gallus gallus با شماره دسترسی BAC57576.1 و کمترین شباهت متعلق به جنس هاTetrastessewerzowi وAAF65702.1 با شماره دسترسیChrysolophusamherstiae و گونه هایبا شماره دسترسی ABH01111.1 با %80شباهت در %100طول خود بود. همچنین توالیاسیدآمینهای مرغ بومی خراسان با توالی مرجع و سایر توالی ها با شماره مرجع ،YP272073.1% طول نشان100 % در99 شباهتADW41566.1 وADB06584.1 ،NP_006916.1 ،BAD11115.1داد. پس از تبدیل توالی نوکلیوتیدی بدست آمده به توالی اسیدآمینه ای، با توالی پروتیینی مرجعمقایسه شد. نتیجه این مقایسه تفاوت در یک اسیدآمینه را نشان داد. در اسیدآمینه 130لوسین کهاسیدآمینه ای غیرقطبی است به اسیدآمینه غیرقطبی متیونین تبدیل شد. جهش های مشاهده شدهدر این تحقیق از آنجایی که منجر به تغییر اسید آمینه شده است میتوان به عنوان یک پایه دربررسی های اختلالات سوخت وساز و صفات تحت تاثیر ژن MT-DNA در مطالعات بعدی قرارگیرد

Keywords:

همسانه سازی , تعیین توالی , MT ND2 , مرغان بومی خراسان