شناسایی ژن گلوتاتیون پراکسیداز سیر و مطالعه فیلوژنتیکی آن

Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 644

This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NMPC01_045

تاریخ نمایه سازی: 11 مرداد 1396

Abstract:

گلوتاتیون پراکسیداز یکی از آنزیم های کلیدی در سیستم دفاع آنتی اکسیدانی سلول است که نقش مهمی را در پاسخ به استرس های محیطی ایفا می کند. هدف این مطالعه شناسایی ژن گلوتاتیون پراکسیداز سیر و بررسی فیلوژنتیکی آن می باشد. برای شناسایی ژن گلوتاتیون پراکسیداز از توالی های EST سیر موجود در EST database پایگاه NCBI و جستجو برای شباهت توالی (tblastn و blaxix) استفاده شد. سپس توالی های بدست آمده با استفاده از ابزار ترجمه ExPASy ترجمه شده و الگوهای حفظ شده آنها با PROSITE مورد بررسی قرار گرفت. برای پیش بینی ساختار دوم و سوم پروتیین به ترتیب از PSIPRED و Phyre2 استفاده شد. همردیفی توالی ها با استفاده از Clustal Omega انجام پذیرفت و درخت فیلوژنتیکی با استفاده از MEGA3 و روش نزدیکترین هماسیه رسم گردید. نتایج نشان داد FS209961, 1 EST مربوط به گلوتاتیون پراکسیداز سیر می باشد. پروتیین پیش بینی شده متشکل از 251 اسید آمینه با یک جایگاه فعال و یک الگوی حفظ شده متعلق به خانواده گلوتاتیون پراکسیدازها بود. همردیفی با Clustal Omega و آنالیز درخت فیلوژنتیکی نشان داد که این پروتیین بالاترین و کمترین شباهت را به ترتیب با گلوتاتیون پراکسیداز نخود و کلامیدوموناس دارد.

Authors

محبوبه زارع مهرجردی

دانشگاه تهران، پردیس ابوریحان، گروه باغبانی، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Bela, K., Horvath, E., Galle, A., Szabados, L., Tari, I., ...
  • Ganguli, S., _ Datta, A. 20] 15. Revidue Frequencies and ...
  • Kim, D.W., Jung, T.S., Nam, S.H., Kwon, H.R., Kim, A., ...
  • Margis, R., Dunand, C., Teixeira, F.K., and Margis-Pin heiro, M. ...
  • Milla, M.A.R., Maurer, A., Huetc, A.R., _ Gustafson, J.P. 2003. ...
  • نمایش کامل مراجع