آنالیز بیوانفورماتیکی پروموتور ژن بتا آمیرین سنتاز کاسنی در گیاهان مدل آرابیدوپسیس و برنج

تری ترپن ساپونین ها یکی از مهم ترین متابولیت های ثانویه در گیاه کاسنی هستند که در صنعت و پزشکی از اهمیت ویژه ای برخوردارند. در بین تری ترپن ساپونین ها معمول ترین نوع، بتا آمیرین می باشد که توسط آنزیم بتا آمیرین سنتاز با پیش ماده اکسید و اسکوالن ایجاد می شود. در رابطه با ژن سنتز کننده این آنزیم و توالی پروموتوری آن در گیاه کاسنی، اطلاعات کافی در بانک های ژنی وجود ندارد. از این رو در این مطالعه به بررسی ناحیه پروموتوری ژن بتا آمیرین سنتاز به عنوان یک ژن کلیدی در مسیر بیوسنتز ساپونین ها در گیاهان مدل آرابیدوپسیس و برنج پرداخته شد. به این منظور توالی پروموتوری ژن بتا آمیرین سنتاز آرابیدوپسیس و برنج از بانک اطلاعاتی NCBI دریافت شد. بررسی پروموتور ها با استفاده از سایت Plant CARE انجام، موتیف ها و نواحی Cis- regulatory elementsموجود در هر پروموتور و نقش آن ها مشخص گردید. نتایج نشان داد پروموتور این ژن در هر دو گیاه، جز پروموتور های القا پذیر (Inducible promoters)بوده و متاثر از استرس های زیستی و غیر زیستی می تواند باعث تغییر در بیان ژن مربوطه گردد

Keywords:

بتا آمیرین سنتاز , پروموتور , کاسنی , آرابیدوپسیس , برنج