مقایسه جایگاه های هدف میکروRNA ویروس BLVS در ژن های موجود در QTLهای مرتبط با حساسیت به این ویروس

ویروس BLVS از خانواده رتروویروس ها می باشد که دارای آنکوژن Tax بوده و با تلفیق در DNA سلول های B گاوی عامل توموری شده یا افزایش تکثیر آن ها می باشد. این ویروس علاوه بر ژن های ساختاری خود میکرو RNA را کد می کند که نقش خاصی برای آن مشخص نگردیده است. فرض آزمایش حاضر بر آن است که ژن هایی از ژنوم گاو که هدف این میکروRNA می باشند در QTLهای مربوط به حساسیت به BLVS بیشتر از سایر قسمت های دیگر ژنوم گاوی است. بدین منظور با برنامه تهیه شده در پایتون 3’UTR های کل ژن های گاو مورد آنالیز تارگت اسکن بصورت canonical، marginal و atypical قرار گرفت. نتایج این آنالیز نشان داد که ژن موجود در 9 QTL مرتبط با حساسیت به BLVS که بر روی کروموزوم های 1، 3، 4، 8، 22 و 23 قرار داشتند بطور معنی داری بیشتر هدف تنظیم بیان وابسته به میکروRNA ویورس BLVS قرار گرفتند. با عنایت به اهمیت رتروویروس BLVS به عنوان کاندیدایی برای شروع برخی تومورها در انسان، نتایج این تحقیق می تواند درکی عمیق تر از علت حساسیت رتروویروس ها در بین افراد مختلف را مشخص نماید

Keywords:

اBLVS , میکرو RNA ویروسی , Target scan. پایتون