طراحی سازه مناسب جهت بیان آر ان ای سنجاق سری ویروسی به منظور ایجاد مقاومت به سه ویروس مهم آلوده کننده کلزا

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 431

This Paper With 9 Page And PDF and WORD Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

BIOTECH01_131

تاریخ نمایه سازی: 13 شهریور 1396

Abstract:

کلزا از مهمترین گیاهان دانه روغنی کشور محسوب می شود که عوامل بیماریزای مختلفی باعث کاهش عملکرد آن می شوند. شیوع سه ویروس موزاییک شلغم (Turnip mosaic virus, TuMV)، ویروس موزاییک کلم گل (Cauliflower mosaic virus, CaMV) و ویروس زردی غربی چغندرقند (Beet western yellow virus, BWYV) از مزارع کلزای کشور به طور گسترده گزارش شده است. از این جهت ایجاد یک لاین مقاوم کلزا از طریق خاموشی آر ان آ و القای بیان یک آر ان ای سنجاق سری که بتواند در برابر هر سه ویروس از مقاومت قابل توجهی برخوردار باشد اهمیت دارد. بدین منظور توالی های نوکلیوتیدی از ژنوم سه ویروس مذکور، از بانک ژنی دریافت شد. سپس به منظور شناسایی مناطق حفاظت شده، برای هر یک از گونه ها هم ردیف سازی توالی نوکلیوتیدی ژن CP با استفاده از برنامه MEGA5 انجام شد. توالی150 نوکلیوتیدی از مناطق حفاظت شده این ژن از ویروس های موزاییک شلغم (از نوکلیوتید شماره 787 تا 937)، ویروس موزاییک کلم گل (از نوکلیوتید شماره 295 تا 445) و ویروس زردی غربی چغندرقند (از نوکلیوتید شماره 87 تا 237) انتخاب و پس از قرارگیری در کنار یکدیگر یک توالی 450 نوکلیوتیدی به دست آمد. جهت بررسی عدم امکان خاموشی آر ان آ های میزبان توالی ترکیبی با استفاده از اطلاعات سایت siRNA Scan مورد بررسی قرار گرفت. سپس پیش بینی امکان همسانه سازی آن در یک ناقل دوگانه مناسب با استفاده برنامه Vector NTI version 8.0 انجام شد. درنهایت امکان بیان ساختار آر ان ای سنجاق سری با استفاده از برنامه RNA structure و سایت RNAfold مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج مطالعات بیوانفورماتیکی این پژوهش پیش بینی کرد که قابلیت بیان آر ان ای سنجاق سری پس از همسانه سازی در حامل مناسب و انتقال به کلزا در شرایط آزمایشگاهی وجود دارد.

Keywords:

کلزا , ویروس , خاموشی آر ان آ , مقاومت

Authors

مجید جعفری

استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، مجتمع آموزش عالی سراوان

عبدالباسط عزیزی

استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان

راضیه منتظری

استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز