محمد حسین بنابازی - عضو هیات علمی موسسه تحقیقات علوم دامی کشور
الهام بهدانی - دانشجوی مقطع دکتری، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان

شناسایی اختلافات ژنتیکی نقش مهمی در فهم ارتباط بین ژنوتیپ و فنوتیپ دارد. در این مطالعه به منظور بررسی ژن ها/ پلیمورفیسم های تک نوکلیوتیدی تاثیرگذار بر مکانیسم مولکولی مقاومت ژنتیکی نسبت به آنفولانزا طیور به فراخوانی پلیمورفیسم های تک نوکلیوتیدی پرداخته شد. داده های توالییابی اسید ریبونوکلییک مربوط به دو لاین فاریومی و لگهورن که دارای واکنش ایمنی متفاوت در برابر آنفولانزای طیور هستند، پیاده سازی شده و کیفیت آنها به کمک FastQC بررسی گردید. ویرایش داده ها با استفاه از Fastx انجام شد. نرم افزار TopHat2 به منظور مکان یابی و SAMtools 0.1.19 جهت فراخوانی پلیمورفیسم های تک نوکلیوتیدی مورد استفاده قرار گرفت. در این مطالعه 37677 مورد پلیمورفیسم تک نوکلیوتیدی در لاین فاریومی مشاهده شد که تعداد 645 مورد تنها در لاین فاریومی موجود بود و در پلیمورفیسم های تک نوکلیوتیدی فراخوانی شده در لاین لگهورن وجود نداشت. بعد از شناسایی ژن های مرتبط به آن 645 پلیمورفیسم، مشخص شد که 18 تا از این ژن ها جزء ژن هایی می باشند که بین دو لاین تفاوت بیان ژنی متفاوتی را نیز داشته اند. نتایج نشان داد مسیرهای سیگنالدهی Wnt ، تولید سیتوکین ها و چسبندگی سلولی از مهمترین مسیرهای ژنی می باشد که در مقاومت به بیماری آنفولانزای طیور تاثیرگذار است.

پلیمورفیسم تک نوکلیوتیدی، مقاومت به آنفولانزای طیور، داده های RNA-Seq