بررسی بیوانفورماتیکی پتانسیل افزایش دهندگی رشد گیاه توسط Herbaspirillum rhizosphaerae را آشکار می کند

باکتریهای محرک رشد (PGPB) باکتریهای مفید خاک هستند که رشد گیاهان را با مکانیسم های متعددی تحریک می کنند. تهیه غذابرای جمعیت در حال رشد جهان و آلودگی های محیطی هر دو از مشکلات عمده ای هستند که جهان امروز با آنها روبروست. بنابراینشناسایی و اضافه کردن PGPB به گیاهان می تواند منافع افزایش تولید محصولات کشاورزی و کاهش استفاده از کود های شیمیایی را فراهم کند. ارتباط برخی گونه های Herbaspirillum با محصولات کشاورزی خانواده Poaceae نظیر گندم و برنج که از لحاظ اقتصادی مهم هستند، به اثبات رسیده است. در این مطالعه حضور برخی از آنزیم های مهم دخیل در عملکرد های مفید باکتری برای گیاه نظیر در پروتیوم Herbaspirillum rhizosphaerae مورد بررسی قرار گرفت. توالی آنزیم های 1-آمینوسیکلوپروپان 1 کربوکسیلات (ACC) دآمیناز، زیر واحد H نیتروژناز، اندول -3- گلیسرول فسفات سنتاز، نیتریلاز، تریپتوفان ترانس آمیناز، اندول پیروات فردوکسین اکسیدوردوکتاز، اندول- 3- استامید هیدرولاز و اندول- 3- استالدیید دهیدروژناز از پایگاه داده ای Uniprot استخراج شد. توالی های انتخاب شده تحت بررسی BLASTp بر علیه پایگاه توالی پروتیینی غیر تکراری با باکتری منتخب H. rhizosphaerae در سایت NCBI قرار گرفتند. نتایج عدم حضور نیتروژناز و حضور آنزیم تعدیل کننده مقادیر اتیلن (ACC دآمیناز) و برخی از آنزیم های مرتبط با مسیرهای مختلف بیوسنتزی اندوا استیک اسید (IAA) از تریپتوفان را آشکار کرد. حضور آنزیم های ذکر شده ممکن است باعث القاء قابلیت افزایش رشد گیاه توسط باکتری H. rhizosphaerae شود.

Keywords:

, Herbaspirillum rhizosphaerae , باکتریهای افزایش دهنده رشد , آنزیم