فیلوژنی جنس (Brassicaceae) Erysimumبا استفاده از نسل جدید توالی یابی (454 pyrosequencing)

جنس Erysimum با داشتن بیش از 200 گونه، یکی از جنس های بزرگ تیره شب بو است که عمدتا در اوراسیا و با تعداد محدودی در آمریکای شمالی پراکنش دارند Erysimum از لحاظ تاکسونومی یکی از جنس های مشکل تیره شب بو است. مطالعات فیلوژنی قبلی بر روی جنس Erysimum به دلیل وقوع پلی پلوییدی incomplete lineage sorting در تعیین روابط بین گونه ای چندان موفق نبوده اند. بنابراین، در مطالعه حاضر از روش pyro sequencing 454 برای تقویت توالی سه نشانگر کم/تک نسخه ای به نام های Adh ،pistillata و Luminidependens از 90 گونه مختلف جنس Erysimum استفاده شد. توالی های بدست آمده بعد از ویرایش بوسیله رویکرد Maximum Bayesian و likelihood برای هر نشانگر یه صورت جداگانه مورد آنالیز قرار گرفتند. توپولوژی درختان حاصل از هر دو آنالیز برای هر مارکر یکسان بودند و تک نیا بودن جنس Erysimum را تایید کردند. همچنین بر روی درختان حاصل از این آنالیزها روابط بین گونه های تا حدودی حل شده بودند و به نظر می رسد گونه های غرب مدیترانه جدیدتر از سایر گونه ها بود و اخیرا بوجود آمده اند. همچنین آنالیز بیوجغرافیایی نشان داد که این جنس احتمالا در منطقه ای بین جنوب غربی آسیا و شرق مدیترانه تکامل یافته است و به سایر نقاط نیمکره شمالی گسترش پیدا کرده است

Keywords:

لاتین Erysimum , تیره شب بو , فیلوژنی , نسل جدید توالی یابی NGS