آنالیز پروموتر ژن PAL در چندین گونه ی گیاهی

گیاهان به دلیل دارا بودن ترکیبات ثانویه و مواد آنتی اکسیدانی حایز اهمیت بسزایی در حوزه ی سلامت و داروسازی می باشند. آنزیم فنیل آلانین آمونیالیاز PAL یک آنزیم حدواسط بین متابولیسم اولیه و ثانویه ترکیبات فنیل پروپانوییدی می باشد. القای این ژن، سنتز مواد فلاونوییدی در گیاه را سبب خواهد شد. عوامل مختلفی در القای این ژن دخالت دارند. بنابراین بررسی پروموتر ژن PAL به عنوان یک آنزیم تنشی هدف پژوهش حاضر قرار گرفت. در همین راستا توالی CDS و 1500 جفت باز بالادست این ژن در چندین گونه ی مختلف گیاهی، از پایگاه داده های زیستی استخراج گردید سپس عوامل تنظیمی با استفاده از نرم افزار PlantCARE مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی پروموتر بیانگر این واقعیت بود که ناحیه ی پروموتری ژن PAL دارای تعداد عناصر تنظیمی متنوعی بسته به گونه ی گیاهی در پاسخ به عوامل مختلف محیطی و تنش های زیستی می باشد. هسته ی مرکزی پروموتر ژن TATA-box ،PAL و معمول ترین عنصر تنظیمی سیس CAAT-box بود. از جمله عناصر تنظیمی دیگر می توان عناصر تنظیمی مرتبط با پاسخ به نور، القای تنفس بی هوازی، بیان آندوسپرم کنترل سیرکادین و سایت اتصال MYB را نام برد. بنابراین با مطالعه و بررسی عناصر تنظیمی پروموتر این ژن در گیاهان مختلف می توان به عناصر ویژه ی دخیل در پروموتر ژن PAL و در نتیجه کنترل بهینه ی بیان ژن آن در نتیجه ی مهندسی ژنتیک دست یافت.

Keywords:

فلاونویید , آنالیز بیوانفورماتیکی , عناصر تنظیمی