شناسایی مولکولی و آنالیز تنوع ژنتیکی ریز جلبک Dunaliella بر اساس ژن cob

جلبک تک سلولی Dunaliella یک جلبک سبز با ارزش غذایی و دارویی فراوان است که شناسایی گونه های این جنس با روش های معمول مورفولوژیکی و مطالعات مولکولی مختلف چندان موفق نبوده است. از آنجایی که ژنوم میتوکندریایی نرخ جهش بالایی دارد، ابزاری قوی برای آنالیز فیلوژنتیکی و شناسایی گونه ها در برخی از موجودات محسوب می شود. بطوریکه ژنcob که یک ژن میتوکندریایی است برای بررسی فیلوژنتیکی در برخی از جلبک ها و گیاهان استفاده شده است. بنابراین در مطالعه ی حاضر از ژن cob به عنوان یک نشانگر در بررسی رابطه ی فیلوژنتیکی در جنس Dunaliella استفاده شد. استخراج DNA کل با روش CTAB و استخراج DNA میتوکندریایی با روش مبتنی بر ویژگی بیوشیمیایی DNA میتوکندریایی از ایزوله های موجود انجام گرفت و کیفیت باندهای DNA روی ژل آگارز بررسی شد. مناطق حفاظت شده ی ژن مورد نظر، از طریق پایگاه اطلاعاتی NCBI در گونه های مختلف Dunaliella به وسیله ی برنامه ی Mega4 و Box shade مشخص شده و 4 جفت پرایمر اختصاصی از قسمت های حفاظت شده در ژن مورد نظر با برنامه ی Gene runner طراحی گردید. برنامه ی PCR بهینه شده برای پرایمرهای طراحی شده و همچنین پرایمرهای ژن کلروپلاستی Rbcl و ژن هسته ای ITS انجام گرفت، سپس با توالی یابی محصولات PCR، موقعیت فیلوژنتیکی گونه ها مشخص می شود. بحث توالی یابی این مطالعه هنوز در دست اجراست

Keywords:

لاتین cob , Dunaliella , تنوع ژنتیکی , مطالعات فیلوژنتیکی , PCR