بررسی بیان ژن های جو در پاسخ به تنش اسمزی با استفاده از فن آوری درشت آرایه

جو (.Hordeum vulgare L) گیاهی مدل برای بررسی های ژنتیکی و فیزیولوژیکی است .تنش های غیرزیستی مانند خشکی ، رشد و توسعه گیاه را کاهش می دهند. هدف این آزمایش شناسایی ژن های پاسخ دهنده به تنش اسمزی با استفاده از فن آوری درشت آرایه (دارای 13050 cDNA) بود. در این آزمایش از برگ 5 ژنوتیپ جو در دو شرایط تنش و بدون تنش و در سه زمان 1، 3 و 7 روز پس از اعمال تنش RNA استخراج شد. پس از اندازه گیری بیان ژن ها و تجزیه واریانس داده ها، اثر شرایط در 744 ژن معنی دار بود. تجزیه مولفه های اصلی بر روی ماتریس اثر برهمکنش ژن 3 شرایط نشان داد ژن هایی که در متابولیسم چربی ، مسیر پاسخ به تنش و متابولیسم اسید آمینه فعال هستند، در این آزمایش به تنش پاسخ داده اند. با انجام این تجزیه بر روی ماتریس اثر برهمکنش ژن 3 شرایط 3 ژنوتیپ و اثر برهمکنش ژن 3 شرایط 3 زمان ژن های به دست آمده بیشتر مربوط به تنش ، متابولیسم هورمون و متابولیسم اسید آمینه بودند. پرتعدادترین گروه های ژنی پاسخ دهنده به تنش مربوط به ژن های دی هایدرین و پروتیین های انتقال دهنده لیپید بودند.

Keywords:

بیان ژن , تنش اسمزی , جو , ژن های پاسخ دهنده و درشت آرایه