Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
عنوان
Paper

Detection of Critical Genes Associated with Bovine Staphylococcus aureus (S. aureus) Subclinical Mastitis in Dairy Cattle

تعداد صفحات: 1 | تعداد نمایش خلاصه: 174 | نظرات: 0
سال انتشار: 1396
کد COI Paper: IBIS07_113
زبان Paper: Englishglish
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

مشخصات نویسندگان Paper Detection of Critical Genes Associated with Bovine Staphylococcus aureus (S. aureus) Subclinical Mastitis in Dairy Cattle

Somayeh Sharif - Department of Animal Science, College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran
Abbas Pakdel - Department of Animal Science, College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran
Esmaeil Ebrahimie - Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran

چکیده Paper:

Bovine mastitis, is one of the most common diseases of dairy cattle which is responsible for the rate of elimination, low milk yield and poor milk quality; therefore, it induces significant economic losses in the dairy cattle industry [1]. S. aureus, a Gram-positive pathogenic bacterium, is a major subclinical mastitis-causing pathogen in dairy cattle which is usually asymptomatic, persistent, resistant to antibiotic treatment and easily reoccur [2]. In order to get a higher power of statistical analysis, meta-analysis were used in the current study to combine p-values obtained from individual analysis of datasets extracted from 10 microarray-based datasets which investigate transcriptomic data of mammary gland tissue infected by S. aureus in dairy cows. 185genes showed significantly differentially expressed after meta-analysis (44 genes down and 141 genes up regulate respectively). Sub-Network Enrichment Analysis (SNEA) were used to predefine gene sets which have more significant expression changes downstream targets using pathway studio software [3] on differentially expressed genes. Direct regulatory network between the SENA gene seeds were retrieved and displayed by Pathway studio software. Twenty-two critical genes including extracellular proteins such as: C-X-C motif chemokine ligand 8 (CXCL8), Interleukine 10 (IL10), C -C motif chemokine ligand 3 ( CCL2) and membrane protein such as: Toll like receptor 2 (TLR2) were detected through applying 12 different ranking algorithms of Cytohubba plugin in Cytoscape software on direct regulatory network of SNEA gene seeds .

کلیدواژه ها:

Meta-analysis; Microarray; Transcriptom; S.aureus; SNEA

کد Paper/لینک ثابت به این Paper

برای لینک دهی به این Paper می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت Paper در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/712512/

کد COI Paper: IBIS07_113

نحوه استناد به Paper:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این Paper ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
undefined, undefined و undefined, undefined و undefined, undefined,1396,Detection of Critical Genes Associated with Bovine Staphylococcus aureus (S. aureus) Subclinical Mastitis in Dairy Cattle,هفتمین همایش بیوانفورماتیک ایران,Tehran,,,https://civilica.com/doc/712512

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این Paper اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1396, Sharif, Somayeh؛ Abbas Pakdel و Esmaeil Ebrahimie)
برای بار دوم به بعد: (1396, Sharif؛ Pakdel و Ebrahimie)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

Research Info Management

Certificate | Report Paper

Export Citation info of this Paper to research management softwares

علم سنجی و رتبه بندی Paper

مشخصات مرکز تولید کننده این Paper به صورت زیر است:
نوع مرکز: state university
تعداد مقالات: 13,263
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

Share this paper

WHAT IS COI?

COI is a national code dedicated to all Iranian Conference and Journal Papers. the COI of each paper can be verified online.

Support