مقایسه مولکولی دو فیتوپلاسمای متعلق به زیرگروه 16SrII-D با استفاده از آنالیز چند قطعه ژنومی

فیتوپلاسماها شامل پروکاریوتهای بدون دیواره و بیماریزای گیاهی هستند. امروزه به منظور شناسایی فیتوپلاسماهای نزدیک از ترادف ژنهای کمتر حفاظت شده استفاده میشود. در این مطالعه قرابت دو فیتوپلاسمای عامل فیلودی خیار و جاروک یونجه ) متعلق به گروه 16SrII ( مورد بررسی قرار گرفت. دو فیتوپلاسمای مذکور در ترادف ژن آر.ان.ای ریبوزومی s16 یکسان، و بر این اساس قابل تفکیک نبودند. با طراحی آغازگر، ژنهای کمتر حفاظت شده SecY و rplV-rpsC در این دو فیتوپلاسماها تکثیر و تعیین ترادف شد. ترادفهای مذکور بیشترین شباهت را با ژنهای همتا در فیتوپلاسماهای زیر گروه 16SrII-D نشان دادند. بررسی های انجام شده نشان از تشابه بالای دو فیتوپلاسمای جاروک یونجه و فیلودی خیار در ژن 9( SecY / ) 99 و %100 ( rplV-rpsC ( داشت. در ادامه با طراحی دو آغازگر ترادف قطعات مربوط به اینترونهای موجود در دو فیتوپلاسما تکثیر شد. نتایج نشان داد که در هر دو فیتوپلاسما چندین کپی از این قطعات وجود دارد. هیچ محصولی در PCR گیاهان سالم تولید نشد. همچنین تعدادی از قطعات مربوط به فیتوپلاسماها تعیین ترادف شد و هویت فیتوپلاسمایی آنها تایید شد. نتایج الکتروفورز محصول بدست آمده نشان داد که قطعات اینترونی تکثیر شده در این دو فیتوپلاسما از نظر تعداد و اندازه متفاوت است. از این نظر دو فیتوپلاسمای مذکور قابل تفکیک بودند. بر این اساس عامل بیماریهای جاروک یونجه و فیلودی خیار یک استرین فیتوپلاسما نیست. در این ارتباط عامل این دو بیماری استرینهای فیتوپلاسمایی است که از نظر ژنتیکی بسیار به یکدیگر شبیه هستند. همچنین نتایج این بررسی نشان دهنده توانایی PCR قطعات مربوط به اینترونها برای تفکیک فیتوپلاسماهای گروه 16srII است.

Keywords:

فیتوپلاسما , ژن , اینترون