آنالیز بیوانفورماتیکی hsp70 در نشخوارکنندگان

پروتیین های شوک حرارتی خانواده چند ژنی هستند که اندازه مولکولی آن ها از 10 تا 150 کیلودالتون است و در تمام سلول ها یافت می شوند؛ این پروتیین ها به شدت نقش حفاظتی دارند و برای زنده مانی سلول های موجودات زنده ضروری هستند. در میان تمام پروتیین های شوک حرارتی؛ پروتیین شوک حرارتی 70 بیشترین بیان را در پاسخ به استرس گرمایی دارد. هدف از این بررسی شناسایی تفاوت های بین گونه ایی می باشد.به این منظور تعداد 14 توالی از این ژن جهت بررسی شباهت ها و تفاوت های ژنتیکی بین 4 تا از حیوانات مزرعه ایی استفاده شد. سپس با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج آنالیز باعث شناسایی 71 جهش شد که منجر به ایجاد 13 هاپلوتایپ با تنوع هاپلوتیپی 0/989 در گونه های مورد مطالعه شد. تنوع نوکلیوتیدی 0/01178 و میانگین تفاوت نوکلیوتیدی k=22.692 بود.آنالیز تنوع ژنتیکی نشان داد که بز بیشترین تنوع نوکلیوتیدی را در بین گونه های مورد مطالعه داشت؛ همچنین بررسی درخت فیلوژنتیکی نشان داد که گونه گاو و گاومیش جدمشترک نزدیک به هم دارند. با توجه به تنوع بالا ژن hsp70 در میان گونه های مورد بررسی می توان نتیجه گرفت که این تنوع می تواند دلیلی بر تفاوت مقاومت به استرس های گرمایی در بین دام های مورد مطالعه باشد

Keywords:

ژن hsp70 , هاپلوتیپ , درخت فیلوژنتیکی , تنوع ژنتیکی