مطالعه تاثیر اندازه ی متفاوت جمعیت مرجع و رابطه ی خویشاوندی بر صحت ایمپیوتیشن ژنوتیپ در گاومیش های ایتالیایی

در این مطالعه تاثیر اندازه ی متفاوت جمعیت مرجع و رابطه ی خویشاوندی جمعیت آزمون با گروه مرجع با استفاده از روش ایمپیوتیشن FImpute با استفاده از اطلاعات 920 راس گاومیش مدیترانه ای ایتالیایی که با تراشه های Axiom Buffalo 90k SNP-Chip تعیین ژنوتایپ شده بودند مورد بررسی قرار گرفت. نشانگرهایی که دارای فراوانی آلل نادر بالایی بودند به عنوان کاندیدا برای چیپ کم تراکم 10k انتخاب شدند. تعداد 42، 77، 202، 412 و 732 فرد به عنوان افراد گروه مرجع و حیوانات 4 نسل اخیر شامل 183 فرد به عنوان جمعیت آزمون انتخاب شدند. ماتریس رابطه ی خویشاوندی آللی برای جمعیت تشکیل شد و رابطه ی خویشاوندی افراد جمعیت آزمون با جمعیت مرجع محاسبه شد. نتایج نشان داد که افزایش اندازه ی جمعیت مرجع باعث افزایش صحت ایمپیوتیشن می شود. رابطه ی خویشاوندی افراد جمعیت آزمون با جمعیت مرجع صحت ایمپیوتیشن را مخصوصا هنگامی که اندازه ی جمعیت مرجع کم بود بیشتر تحت تاثیر قرار داد.

Keywords:

گاومیش , صحت ایمپیوتیشن , جمعیت مرجع , رابطه خویشاوندی