مقایسه ساختار ژنتیکی گاومیش با گاو هلشتاین با استفاده از تراشه های SNP
Publish place: The 3th National Conference on Iranian Buffalo
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 460
This Paper With 9 Page And PDF and WORD Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NCIB03_061
تاریخ نمایه سازی: 11 خرداد 1397
Abstract:
در این پژوهش با هدف بررسی ساختار ژنتیکی ژنوم گاومیش با گاو هلشتاین از چیپ 50 کی و 777 کی گاوی استفاده شد. تعداد 1089 نمونه اسپرم از گاونر هلشتاین ایتالیا و 384 نمونه خون از گاومیش های ماده کشور برزیل تهیه و تعیین ژنوتیپ به ترتیب با استفاده از چیپ 50 کی و 777 کی شرکت ایلومینا انجام شد. تصحیح داده ها با Plink انجام گرفت و مقدار پیوستگی نامتعادل با دو پارامتر r2 و Dˊ محاسبه شد. متوسط MAF در کروموزوم های مختلف هلشتاین بین 0/20 تا 0/29 بود و که از متوسط MAF در گاومیش(0/13± 0/14) بیشتر بود. سطح پیوستگی نامتعادل در هر دو گونه با افزایش فاصله بین مارکر ها کاهش یافت. پارامتر r2 در جمعیت گاومیش ها بالاتر از جمعیت هلشتاین بود و اندازه موثر جمعیت در گاومیش نسبت به اندازه موثر جمعیت در هلشتاین کمتر بود، که نشان دهنده بسته بودن جمعیت و سطح بالای پرورش خویشاوندی در گاومیش بود. بطور کلی نتایج این پژوهش نشان داد که ساختار ژنتیکی دو گونه شباهت زیادی با یکدیگر دارد، لذا تراشه های SNP که بیشتر با هدف اصلاح نژاد در گونه گاو طراحی شده اند قابل استفاده در مطالعات ارتباطی وانتخاب ژنومی گاومیش نیز می باشند
Keywords:
Authors
مریم نصرتی
استادیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران