ارزیابی مسیرهای بیولوژیکی پاسخ ایمنی مرغ ها به ویروس H5N1 با استفاده از نرم افزارPath Visio

مرغ و اردک میزبانهای اصلی ویروس H5N1 هستندمعمولا. ویروس آنفلوانزا در مرغ ها سبب بروز علایم ظاهری و بیماری زودگذر میشود. هدف مطالعه حاضر استفاده از داده های ریزآرایه برای بررسی مسیرهای بیولوژیکی فعال در عفونت H5N1 مرغ هاست. برای انجام این بررسی داده های ریزآرایه از بانک اطلاعاتی ebi.ac.uk/arrayexpress; ) ArrayExpress (Accession No: E-GEOD-53931 استخراج شد. داده های فوق مربوط به یک مطالعه روی بیان کلی ژنهای شش مرغ های آلوده به ویروس H5N1 سویه CK10 بود. کیفیت داده ها توسط امکان موجود در وب سایت ArrayAnalysis.org انجام گرفت. سپس با استفاده از نرم افزار Path Visio ورژن 3.2.2 مسیرهای بیولوژیکی رسم شد. تعداد ژنهایی که در مسیرهای بیولوژیکی مداخله داشتند و شامل معیارهای کنترل کیفیت بودند 172 بود. دو مسیر بیولوژیکی با معیار Z معنیدار شناسایی شدند. EPO Receptor Signaling 1,2 و EGFR1 Signaling Pathway در پاسخ به H5N1 فعال بودند. ژنهای زیادی در این دو مسیر افزایش یا کاهش بیان داشتند که لازم است از لحاظ نوع عملکرد و ساختار بررسی شوند.

Keywords:

ویروس H5N1 , آنالیز مسیر , ریزآرایه , مرغ