مطالعه شبکه ژنی موثر بر رشد ماهیچه سینه جوجه راس تحت داده های

جوجه های بومی جز مهمترین ذخایر ژنتیکی هستند که به شرایط محیطی بخوبی سازگاری یافته اند. اما بطور معمول سرعت رشد و راندمان غذایی آنها در مقایسه با جوجه های امروزی نامناسب است. مطالعات مقایسه ای بین جوجه های امروزی و جوجه بومی امکان درک علل این تفاوتهای ژنتیکی را مهیا میسازد. جهت بررسی تفاوتهای ترانسکریپتومی ژنها و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با رشد ماهیچه سینه در دو گروه جوجه بومی و جوجه تجاری از مطالعات ژنومی تکنولوژی های توالی یابی نسل آینده استفاده شد. در این پژوهش تعداد 200 قطعه پرنده از سویه راس 708 و 200 قطعه جوجه بومی اصفهان در یک شرایط مشابه مدیریتی و تغذیه استاندارد پرورش داده شدند. در بررسی تجزیه و تحلیل داده های RNA-Seq بین دو گروه آزمایشی،پروفایل بیان ژن در 4 نمونه ماهیچه سینه 28 روزگی عمر جوجه ها مورد مقایسه قرار گرفت. مقایسه آماری بیان ژن های توالی یابی شده در این دو گروه، 606 ژن با تفاوت معنیدار را مشخص کرد. در جوجه تجاری از این تعداد 357 ژن افزایش بیان و 249 ژن کاهش بیان نشان دادند. شبکه برهم کنش پروتیین- پروتیین با استفاده از 267 ژن تشکیل و از این تعداد 75 ژن در قالب سه ماژول با حداکثر سطح معنی داری شناسایی شد. بررسی های هستی شناسی ژنی نشان داد هر سه ماژول در رشد ونمو ماهیچه سینه نقش موثری را ایفا کرده و ژن های شاخص آنها،EGR1 ،JUN ACTA و 2 ITGA4 ،THBS1 بودند

Keywords:

جوجه راس , شبکه ژنی , ماهیچه , هستی شناسی ژن , توالی یابیRNA