تنوع ژنتیکی زنگ درختان پسته اهلی و زنگ بنه در استان فارس

یکی از بیماری های مهم درختان بنه، زنگ بنه Pileolaria terebinthi میباشد. با توجه به تغییرات اقلیمی چند سال گذشته و گسترش مناطق آلوده به این بیماری، شناسایی ژنتیک زنگ و مقایسه تنوع ژنتیکی زنگ درختان پسته اهلی و وحشی الزامی به نظر می آید. برای این منظور، اسپورهای زنگ درختان بیمار در سال های 94 - 96 از جنگل های بنه و باغ های پسته برخی شهرستان های استان فارس جمع آوری گردید. در بررسی های ماکروسکوپی و میکروسکوپی اسپورهای زنگ تفاوت دیده شد. استخراج DNA قارچ، به روش CTAB و استفاده از کیت استخراج DNA انجام شد. برای تکثیر DNA، واکنش زنجیرهای پلیمراز با آغازگرهایITS1F / ITS4 ، Rust1 / Rust3 و Rust1 ITS1 / صورت گرفت. محصول واکنش PCR به صورت باند در اندازه 1200bp مشاهده شد. بررسی موقعیت فیلوژنتیکی جدایه های انتخابی Pileolaria pistacia ، Pileolaria terebinthi و جدایه های موجود در بانک ژن، آنالیز داده ها و رسم درخت فیلوژنی با دو روش Neighbour Joining و Maximum Likelihood بر اساس نرم افزار MEGA 6 نشان داد که جدایه های زنگ جمع آوری شده متعلق به Pileolaria terebinthi از خانواده Pileolariaceae میباشند. شباهت نوکلیوتیدی جدایه ها با یکدیگر %99 بود و یک گونه را نشان دادند ولی در سطح گونه در ناحیه 28S متفاوت بودند. این پژوهش نشان داد که فقط با بررسی ناحیه ITS نمیتوان تفاوت درون گونه ای را نشان داد و باید نواحی مانند بتاتوبولین، COX1 و کالمودولین مورد بررسی قرار گیرد.

Keywords:

بنه , پسته , تنوع ژنتیکی , زنگ