بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپ‎های زیره‎سبز (Cuminum cyminum) خراسان با استفاده از نشانگرهای رپید و آی اس اس آر

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 569

This Paper With 24 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-11-1_004

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

Abstract:

هدف: تعیین میزان تنوع ژنتیکی در مواد گیاهی، گام اولیه برای شناسایی، حفظ و نگه‎داری ذخایر توارثی و همچنین پایه و اساس تحقیقات ژنتیکی و برنامه‎های اصلاحی است. هدف از این پژوهش بررسی تنوع ژنتیکی و دسته بندی اکوتیپ های زیره سبز جمع آوری شده از استان های خراسان شمالی، رضوی و جنوبی بر اساس نشانگرهای RAPD و ISSR بود.   موادوروش­ها: در ‎‎این تحقیق 20 اکوتیپ مختلف زیره سبز به منظور استخراج DNA در دانشکده کشاورزی بیرجند کشت گردید. کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاده از دو روش نانودراپ و الکتروفورز ژل آگارز‎‎ یک درصد مورد بررسی قرار گرفت. برای بررسی تنوع ژنتیکی از نه آغازگر RAPD  و 30 آغازگر ISSR  استفاده شد. نتایج: نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که بین و درون جمعیت ها تنوع وجود دارد. بر اساس نشانگر RAPD، 10 درصد از تغییرات مربوط به بین جمعیت‎ها و 90 درصد مربوط به درون جمعیت‎ها و بر اساس نشانگر ISSR، نه درصد از تغییرات مربوط به بین جمعیت‎ها و 91 درصد مربوط به درون جمعیت‎ها بود. درصد چندشکلی بدست آمده از نشانگر RAPD و ISSR به ترتیب 62 و 70 درصد؛ میانگین محتوای چندشکلی 26/0 و  3/0؛ میانگین شاخص اطلاعاتی شانون 37/1 و 9/1 و میانگین شاخص اطلاعاتی نی 1/2 و 76/2 بدست آمد. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که در نشانگر RAPD دو مولفه اول 6/40 درصد و در نشانگر ISSR چهار مولفه اول 6/49 درصد از تغییرات را توجیه کردند. تجزیه خوشه ای بر اساس ماتریس تشابه اکوتیپ‎های مورد مطالعه را به ترتیب در 6 و 7 خوشه گروه بندی نمود. نتیجه گیری: با توجه به اطلاعات حاصله از جمله، درصد چند شکلی، دامنه زیاد بین ضرایب تشابه (جاکارد) حاصل شده و گروه بندی اکوتیپ‎ها در خوشه های مجزا، بین اکوتیپ‎های زیره مورد مطالعه تنوع ژنتیکی وجود دارد. از سوی دیگر بین تنوع ژنتیکی موجود در اکوتیپ‎های جمع آوری شده و موقعیت جغرافیایی، در بیشتر موارد ارتباط وجود داشت.

Keywords:

بای پلات , تجزیه به مختصات اصلی , تجزیه خوشه‎ای

Authors

محمد ضابط

گروه زراعت- دانشکده کشاورزی- دانشگاه بیرجند

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • باقری عبدالرضا، محمودی علی اکبر  (1381) زیره سبز، فناوری تولید ...
  • بهادر یاسر ، محمدآبادی محمدرضا، خضری امین و همکاران (1395) ...
  • عسکری ناهید ، باقی زاده امین ، محمدآبادی محمدرضا (1389) ...
  • فارسی محمد، باقری عبدالرضا (1388) اصول اصلاح نباتات. انتشارات جهاد ...
  • نقوی محمدرضا، قره یاضی بهزاد، حسینی سالکده قاسم (1392) نشانگرهای ...
  • Anderson JA, Churchill GA, Sutrique JE et al. (1993) Optimizing ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2010) Study of genetic ...
  • Askari N, Mohammadabadi MR, Baghizadeh A (2011) ISSR markers for ...
  • Bagheri AA, Mahmoodi AA (2002) Cumin production and processing technology. ...
  • Baghizadeh A, Salar Karimi M, Pourseyedi SH (2013) Genetic diversity ...
  • Bahador Y, Mohammadabadi MR, Khezri A et al. (2016) Study ...
  • Bahraminejad AR, Mohammadi-Nejad GH, Abdul Kadir M, Bin- Yusop MR ...
  • Choudhary SH, Meena RS, Singh R, Panwar A (2015) Analysis ...
  • Farsi M, Bagheri AR (2009) Principles of Plant Breeding. Mashhad ...
  • Ghasemi M, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2010) Determination of genetic ...
  • Giovannoni JJ, Wing RA, Ganal MW, Tanksley SD (1991) Isolation ...
  • Hashemi H, Safarnejad A, Bagheri AR (2008) Study of genetic ...
  • Kafi M, Rashed-Mohassel MH, Koocheki A, Mollafilabi A (2002) Cumin ...
  • Kapital B, Feyissa T, Yohannes P, Said M (2015) Molecular ...
  • Kimura M, Crow JF (1963) The measurement of effective population ...
  • Koocheki AR, Nasiri-Mahallati M, Najafi F (2004) Biological diversity of ...
  • Kumar P, Gupta VK, Misra AK et al. (2009) Potential ...
  • Lewontin RC (1972) The apportionment of human diversity. Evolution Biology ...
  • Lynch M, Milligan B (1994) Analysis of population-genetic structure using ...
  • Madhuri P (2012) Appraisal of Genetic Diversity in Cuminum cyminum ...
  • Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (2017) Using Inter Simple ...
  • Naghavi MR, Gharehyazi B, Hosseini-Salekdeh GH (2013) Molecular markers. University ...
  • Nei M (1987) Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University ...
  • Nei M, Li WH (1979) Mathematical model for studying genetic ...
  • Powell W, Morgante M, Andre C et al. (1996) The ...
  • Rostami-Ahmadvandi H, Cheghamirza K, Kahrizi D, Bahraminejad S (2013) Comparison ...
  • Singh SK, Kakani RK, Meena RS et al. (2012) Genetic ...
  • Sudupak MA, Akkoya MS, Kence A (2002) Analysis of relationships ...
  • Uzun A, Yesiloglu T (2012) Genetic diversity in citrus, genetic ...
  • Wright S (1951) The genetical structure of populations. Ann of ...
  • Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (2015) Associations of inter ...
  • Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR et al. (2011) Genetic ...
  • نمایش کامل مراجع