بررسی جایگاه تاکسونومی جدایه های باکتری سودوموناس در گروه پوتیدا و خصوصیات عملکردی آنها

گروه پوتیدا یکی از گروههای مهم در جنس سودوموناس میباشد این گروه دارای 17 تایپ استرین میباشد. اعضای این گروه دارای توانمندی های مختلفی از جمله زیستپ الایندگی، آنتاگونیستی، محرک رشد گیاهی و برخی جدایه های کلینیکی میباشند. در این تحقیق جایگاه تاکسنومی 17 تایپ استرین و 46 جدایه مربوط به این گروه بوسیله اتصال 3 ژن حفاظت شده rrS, rpoD و gyrB با رسم درخت فیلوژنی بررسی گردید. درخت فیلوژنی رسم شده به 11 خوشه تقسیم شد. به منظور بررسی ارتباط بین درخت فیلوژنی و خصوصیات عملکردی جدایه ها هر خوشه، توانایی هر جدایه از منابع مربوطه تعیین گردید. بررسی جایگاه تاکسنومی جدایه ها این گروه نشان داد که تعداد زیادی از جدایه های این گروه به اشتباه نامگذاری گردیدند که نیاز به بازنگری در نامگذاری میباشند. همچنین مشخص گردید برخی از خوشه ها محل تجمع جدایه هایی با توانمندی مشابه هستند. همه جدایه ها در خوشه یک جدایه های زیست پالاینده بوده و جدایه های موجود در خوشه های 3، 6 و 10 جدایه های مفید گیاهی میباشند. برخی از خوشه ها نیز دارای چندین جدایه با تواناییهای متفاوت و یا دارای جدایه هایی با چندین توانایی میباشند. نتایج این تحقیق نشان داد که با بررسی فیلوژنی جدایه های این گروه میتوان تا حدودی خصوصیات عملکردی آنها را پیش بینی کرد.

Keywords:

فیلوژنی , ژنهای حفاظت شده , خوشه بندی , تایپ استرین