شناسایی مولکولی قارچ Periconia macrospinosa برای نخسین بار در ایران

با توجه به روند افزایشی مواجهه با گونه های قارچی بیماری زا در کشاورزی،عفونت های بیمارستانی و استفاده از گونه های مفید قارچی در صنعت، داروسازی، زیست فناوری و علوم وابسته و کشف گونه های پنهان(Cryptic species) که به خاطر فقدان ویژگی های بارز مورفولوژیک از همدیگر براساس معیارهای ریخت شناختی از یکدیگر قابل تفکیک نیستند، اهمیت استفاده از روش های دقیقتر و با کارآمدی بالا درتفکیک گونه های قارچی دو چندان می نماید. قارچ Periconia macrospinosa طی مطالعه ی قارچ های اندوفیت درختان ولیک جداسازی و شناسایی شد. نمونه برداری ازسر شاخه های سالم درختان Crataegus pentagyna انجام پذیرفت. جداسازی قارچ های اندوفیت از نمونه های گیاهی با استفاده از روش ژولر و همکاران (1993) با اندکی تغییرات انجام شد. به منظور شناسایی مولکولی، استخراج DNA به روش CTAB صورت گرفت. ناحیه ژنومی ITS-rDNA با استفاده از جفت آغازگرهای ITS4 و ITS5 تکثیر گردید. برای بررسی جایگاه قارچ بین گونه های مختلف این جنس درخت فیلوژنتیکی با نرم افزار Mega7 برای گونه بدست آمده در این تحقیق و گونه های مشابه در ژن بانک NCBI رسم شد. ناحیه ITS برای تفکیک گونه مورد مطالعه مربوط به جنس Periconia در این تحقیق مناسب بوده است. براساس خصوصیات مورفولوژیکی، جدایه بدست آمده مورد مطالعه قرار گرفت و نتایج حاصله بررسی مولکولی را تایید کرد. قارچ Periconia macrospinosa آرایه جدیدی برای مایکوفلور ایران می باشد. همچنین برای اولین بار به عنوان قارچ اندوفیت درختان Crataegus pentagyna در دنیا گزارش می شود.

Keywords:

Periconia macrospinosa , ITS-rDNA , اندوفیت , آرایه جدید