یوسف نادری - استادیار و عضو هیات علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد آستارا

هدف از این تحقیق ارزیابی مدل­های تک-صفتی و چند-صفتی در سناریوهای مختلف ژنومی با در نظر گرفتن جانهی جهت برآورد صحت پیش­بینی ژنومی و تشخیص وجود اثر متقابل ژنوتیپ و محیط (G × E) بود. داده های ژنومی با تعداد متفاوت جایگاه­های صفات کمی (90 و 900) و سطوح مختلف عدم تعادل پیوستگی (کم و زیادLD = ) برای تراکم K50 شبیه سازی شدند. سپس به طور تصادفی 90 درصد نشانگرها حذف و در مرحله بعد این نشانگرها از طریق نرم افزار Flmpute (نسخه 2/2) جانهی شدند. میانگین صحت جانهی در سناریوهای با LD زیاد و کم به ترتیب 976/0 و 943/0 بود. در همه سناریوهای شبیه سازی شده تفاوت جزئی بین صحت ژنومی داده های اصلی و جانهی مشاهده شد. صحت ژنومی با کاهش سطح LD، وراثت­پذیری و همبستگی ژنتیکی بین صفات کاهش یافت. استفاده از مدل چند-صفتی نسبت به مدل تک- صفتی باعث افزایش صحت ژنومی شد. سطح LD و همبستگی ژنتیکی بین محیط­های مختلف، در صورت وجود اثر متقابل محیط و ژنوتیپ نقش مهمی را ایفا کردند. لحاظ کردن اثر متقابل ژنوتیپ و محیط و تاثیر آن بر افزایش صحت ژنومی از یک طرف و جانهی تراشه های با تراکم کم به تراکم زیاد (خصوصا در سناریوهای با LD بالا) جهت کاهش هزینه های ژنومی از طرف دیگر، می تواند راه حل مناسب و کاربردی جهت بهبود انتخاب ژنومی باشد.

صحت جانهی, صحت ژنومی, عدم تعادل پیوستگی, مدل حیوانی چند صفتی, همبستگی ژنتیکی