کاربرد شبکه های تلفیقی به منظور برازش شبکه تنظیم بیان ژنی موثر بر رشد ماهیچه اسکلتی در گاو

فناوری توالی یابی رونوشت های سلولی ابزار قدرتمندی در جهت تجزیه و تحلیل رونوشت های سلولی، در بسیاری از زمینه های تحقیقاتی می باشد. در سال های اخیر پیاده سازی شبکه جهت بررسی روابط بین ژن ها با استفاده از داده های حاصل از این فناوری به درک بهتر سازوکارهای پیچیده فیزیولوژیکی کمک نموده است. در این مطالعه به ساخت شبکه تنظیم بیان ژن و مطالعه روابط بین ژن های دخیل در تشکیل و رشد بافت ماهیچه اسکلتی به کمک توالی یابی رونوشت ها در بافت ماهیچه ای در حال رشد، پرداخته شده است. این پژوهش با پیاده سازی شبکه تلفیقی بر روی داده های ذکر شده، شش فاکتور رونویسی دخیل در تشکیل و رشد بافت ماهیچه اسکلتی را معرفی کرده است. این شش فاکتور رونویسی عبارتند از KLF4 ،FOXM1 ،FOS ،MYBL2 ،KLF10 و FOSB. نقش این فاکتورهای رونویسی در فرایند هایی مانند تکثیر سلول های بنیادی و تمایز آنها، افزایش طول و امتزاج سلول های ماهیچه ای، تکمیل مرحله تمایز و امتزاج سلول های فیبر ماهیچه و تولید میوفیبر و کمک به حفظ خاصیت خودزایایی در سلول های بنیادی بافت ماهیچه اسکلتی مشخص شده است. هستی شناسی مربوط به این فاکتور های رونویسی و ژن هایی که بیانشان تحت تاثیر این فاکتور های رونویسی تغییر می کند، نشان داد که این ژن ها در مسیرهای تولید هگزوز و نوکلئوتیدها فعال هستند. این ژن ها در تنظیم فعالیت های پایه ای سلول مانند تنظیم بیان ژن و رونویسی نیز دخالت داشتند. از این ژن ها می توان به عنوان نشانگر مرتبط با افزایش تولید گوشت در برنامه های اصلاح نژادی بهره برد.

Keywords:

فناوری توالی یابی نسل جدید , شبکه تلفیقی , میوژنز