دانش نوین بیوانفورماتیک آنتی بادی ها جهت اکتشافات دارو - درمانی و تشخیصی

محمد مهدی رنجبر; سعید عطائی کچوئی; نایبعلی احمدی; خدایار قربان

دانش نوین بیوانفورماتیک آنتی بادی ها جهت اکتشافات دارو - درمانی و تشخیصی

Publish place: Veterinary Research & Biological Products، Vol: 31، Issue: 1

Publish Year: 1397

نوع سند: مقاله ژورنالی

زبان: Persian

This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download

دریافت فایل کامل Paper

Certificate
من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

https://civilica.com/doc/886505

شناسه ملی سند علمی:

JR_VTJ-31-1_001

تاریخ نمایه سازی: 12 تیر 1398

Abstract:

چکید ه از زمان پیدایش آنتی بادی های مونوکلونال (mAbs) انقلابی در پزشکی در زمینه کیت های تشخیصی و داروهای درمانی رخ داده است. یکی از زمینه های پیشرفته و رو به ترقی روزافزون در حوزه علم ایمونوانفورماتیک، بیوانفورماتیک آنتی بادی ها می باشد. این زمینه شامل: طراحی آنتی بادی، مدلینگ به روش های مختلف، بهینه سازی و بلوغ افینیتی، داکینگ(Docking)، انسانی سازی و کاهش ایمنی زایی، پایداری، رفع عیوب مخرب ساختار آن و به کارگیری پایگاه های داده در مقیاس صنعتی در جهت مصارف دارویی-درمانی و تشخیصی است. بیوانفورماتیک آنتی بادی یکی از پیچیده و دشوارترین مباحث در طراحی های فوق پیشرفته است که در آینده نزدیک صنعت دارویی و تشخیصی را دگرگون خواهد کرد. هم اکنون نیز داروهایی با این فن آوری معرفی شده و با کارائی بالا در حال استفاده می باشند. این مقاله مروری به ابعاد مختلف این فرایند با به کار گیری علم بیوانفورماتیک پرداخته و برای اولین بار تلاش می نماید محققان ایرانی شاغل در علوم پایه زیستی و دارویی را با حوزه های مختلف این زمینه علمی و چالش های آن آشنا بنماید.

Keywords:

بیوانفورماتیک آنتی بادی , مونوکلونال آنتی بادی , مدل سازی لوپ CDR H3

Authors

محمد مهدی رنجبر

سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج، ایران

سعید عطائی کچوئی

سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج، ایران

نایبعلی احمدی

مرکز تحقیقات پروتئومیکس، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران

خدایار قربان

گروه ایمنی شناسی، دانشگاه علوم پزشکی اجا، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Shirai, H., Prades, C., Vita, R., Marcatili, P., Popovic, B., ...
Ranjbar, M.M., ghelianchian, A., nazoktabar, A., ahmadi, N., khoshnevisan, R.,2013. ...
Ranjbar, M.M., Ahmadi, N.A., Ghorban, K.h., Ghalyanchi Langeroudi. A., Dadmanesh, ...
Motamed, N.,2013. Experimental infection with avian influenza virus subtype H9N2 ...
Abbas, A.K., Lichtman, A.H., and Pillai, S.,2015. Cellular and molecular ...
Ranjbar, M.M., Malekan, M., Mirabad, M.M.,2012. Nanobodies: Evalution structure, benefits ...
Teng, G., Papavasiliou, F.N.,2007. Immunoglobulin somatic hypermutation. Annu Rev Genet ...
Kuroda, D., Shirai, H., Kobori, M., Nakamura, H.,2008. Structural classification ...
Jawa, V., Cousens, L.P., Awwad, M., Wakshull, E., Kropshofer, H., ...
Reddy, S.T., Ge, X., Miklos, A.E., Hughes, R.A., Kang, S.H., ...
Esmaielbeiki, R., Krawczyk, K., Knapp, B., Nebel, J.C., and Deane, ...
Kringelum, J.V., Lundegaard, C., Lund, O., Nielsen, M.,2012. Reliable B ...
Ramaraj, T., Angel, T., Dratz, E.A., Jesaitis, A.J., Mumey, B.,2012. ...
Al-Lazikani, B., Lesk, A.M., Chothia, C.,1997. Standard conformations for the ...
Zemlin, M., Klinger, M., Link, J., Zemlin, C., Bauer, K., ...
Miklos, E., Kluwe, C., Der, S., Pai, S., Sircar, A., ...
Xu, J., Tack, D., Hughes, A., Ellington, D., Gray, J.,2014. ...
Kiyoshi, M., Caaveiro, M., Miura, E., Nagatoishi, S., Nakakido, M., ...
Tharakaraman, K., Robinson, N., Hatas, A., Chen, L., Siyue, L., ...
Chothia, C., Lesk, M., Tramontano, A., Levitt, M., Smith-Gill, J., ...
North, B., Lehmann, A., Dunbrack, R.L,2011. A new clustering of ...
Chailyan, A., Marcatili, P., Cirillo, D., Tramontano, A.,2011. Structural repertoire ...
Verdino, P., Witherden, D.A., Podshivalova, K., Rieder, S.E., Havran, W.L., ...
Sircar, A., Sanni, K.A., Shi, J., Gray, J.J., 2011. Analysis ...
Whitelegg, NR., Rees, A.R.,2000. WAM: an improved algorithm for modelling ...
Zhao, Z., Worthylake, D., LeCour, J., Maresh, G.A., Pincus, S.H., ...
Holm, L., Laaksonen, L., Kaartinen, M., Teeri, T., Knowles, J.K.,1990. ...
Martin, A.C., Cheetham, J.C., Rees, A.R.,1989. Modeling antibody hypervariable loops: ...
Kunik, V., Peters, B., Ofran, Y.,2012. Structural consensus among antibodies ...
Morea, V., Tramontano, A., Rustici, M., Chothia, C., Lesk, A.M.,1998. ...
Choi, Y., Deane, C.M.,2011. Predicting antibody complementarity determining region structures ...
Sela-Culang, I., Alon, S., Ofran, Y.,2012. A systematic comparisonof free ...
Zhu, K., Pincus, D.L., Zhao, S., Friesner, R.A.,2006. Long loop ...
Dunbar, J., Fuchs, A., Shi, J., Deane, C.M.,2013. ABangle: characterising ...
Waldmann, H., and Hale, G.,2005. CAMPATH: from concept to clinic. ...
Novotný, J., Handschumacher, M., Haber, E., Bruccoleri, R.E., Carlson, B., ...
Hu, W.G., Yin, J., Chau, D., Negrych, L.M., Cherwonogrodzky, J.W., ...
Sundberg, E.J., Urrutia, M., Braden, B.C., Isern, J., Tsuchiya, D., ...
Moreira, I.S., Fernandes, P.A., Ramos, M.J.,2007. Hot spot computational identification: ...
Wang. X., Das. T.K., Singh. S.K., Kumar, S.,2009. Potential aggregation ...
Brenke, R., Hall, D.R., Chuang, G.Y., Comeau, S.R., Bohnuud, T., ...
Beck, A., Wagner-Rousset, E., Ayoub, D., Van, D.A., Sanglier-Cianferani, S.,2013. ...
Simpson, R.J.,2010. Stabilization of proteins for storage. Cold Spring Harb ...
Wakankar, A.A., Liu, J., Vandervelde, D., Wang, Y.J., Shire, S.J., ...
Huang, L., Lu, J., Wroblewski, V.J., Beals, J.M., Riggin, R.M.,2005. ...
Yan, B., Steen, S., Hambly, D., Valliere-Douglass, J., Vanden, B.T., ...
Kosky, A.A., Dharmavaram, V., Ratnaswamy, G., Manning, M.C., 2009. Multivariate ...
Schwede, T., Sali, A., Honig, B., Levitt, M., Berman, H.M., ...
Motedayen, M., Nikbakht, G., Rasaee, M., Zare Mirakabadi, A.,2015. Construction ...

نمایش کامل مراجع