تجزیه ارتباط برای مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی یقه ساقه در آفتابگردان (Helianthus annuus L.) با استفاده از نشانگرهای رتروترنسپوزونی REMAP

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 380

This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJFCS-50-1_002

تاریخ نمایه سازی: 15 تیر 1398

Abstract:

آفتابگردان یک محصول مهم زراعی می باشد که روغن آن ارزش غذایی و اقتصادی بالایی دارد. اسکلروتینیا از بیماری های قارچی مهم آفتابگردان می باشد که باعث کاهش رشد و عملکرد محصول می شود. در پژوهش حاضر واکنش 100 لاین خالص آفتابگردان روغنی به 6 جدایه قارچ اسکلروتینیا مورد بررسی قرار گرفت. برای شناسایی مکان های ژنی پیوسته با مقاومت به بیماری از 120 جایگاه ژنومی تکثیر شده توسط آغازگرهای رتروترنسپوزونی REMAP استفاده شد. نتایج نشان داد که برخی ژنوتیپ های آفتابگردان مقاومت خوبی به بیماری اسکلروتینیا دارند. ژنوتیپ 8A×/LC1064C کمترین درصد آلودگی را در پاسخ به دو جدایه قارچیA37 (S. sclerotiorum) و M1 (S. minor) از دو گونه مختلف قارچ اسکلروتینیا نشان داد. در تجزیه ساختار جمعیت با نرم افزارStructure ، 4 زیرجمعیت احتمالی شناسایی شد. در تجزیه ارتباط با نرم افزارTASEEL به دو روشGLM وMLM ، به ترتیب 9 و 8 مکان ژنی شناسایی شد که ارتباط معنی داری (P≤0.01) با ژ ن های کنترل کننده مقاومت به بیماری دارند. طبق نتایج، نشانگرهای CF-UBC826، 1061LTR-UBC818 و 1061LTR-UBC857 با ژن های کنترل کننده مقاومت به دو جدایه قارچ عامل بیماری پیوسته بودند. نشانگرهای شناسایی شده در این تحقیق، در صورت تایید و تبدیل به نشانگر SCAR می توانند بطور موثری در برنامه های گزینش به کمک نشانگر و تولید ارقام مقاوم به بیماری اسکلروتینیا مورد استفاده قرار بگیرند.

Authors

رقیه نجف زاده

محقق پسادکتری، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه. محقق پسادکتری، بنیاد ملی نخبگان، تهران.

رضا درویش زاده

استاد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه. استاد، پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه ارومیه، ارومیه.

خدیجه موسی خلیفانی

دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه.

مسعود ابرین بنا

استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ارومیه، ارومیه.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Abrinbana, M., Mozafari, J., Shams-bakhsh, M. & Mehrabi, R. (2012). ...
  • Amoozadeh, M., Darvishzadeh, R., Davar, R., Abdollahi Mandoulakani, B., Haddadi, ...
  • Basirnia, A., Darvishzadeh, R. & Abdollahi Mandoulakani, B. (2016). Retrotransposon ...
  • Bert, P., Jouan, F., Tourvieille de Labrouhe, D., Seere, F., ...
  • Bert, P. F., Dechamp Guillaume, G., Serre, F., Jouan, I., ...
  • Bolton, M. D., Thomma, B. P. & Nelson, B. D. ...
  • Breseghello, F. & Sorrells, M. E. (2006). Association mapping of ...
  • in wheat (Triticum aestivum L.) cultivars. Genetics, 172, 1165-1177. ...
  • Cardon, L. R. & Palmer, L. J. (2003). Population stratification ...
  • Castaño, F., Vear, F. & Tourvieille de Labrouhe, D. (1993). ...
  • Collard, B. C. Y., Jahufer, M. Z. Z., Brouwer, J. ...
  • Cruickshank, A. W., Cooper, M. & Ryley, M. J. (2002). ...
  • S. sclerotiorum. Australian Journal of Agricultural Research, 53, 1105-1110. ...
  • Dadras, A. R. (2012). Evaluation of genetic diversity of tobacco ...
  • Darvishzadeh, R., Poormohammad Kiani, S., Huguet, T. & Sarrafi, A. ...
  • Darvishzadeh, R. (2012). Association of SSR markers with partial resistance ...
  • Davar, R., Darvishzadeh, R., Majd, A., Ghosta, Y. & Sarrafi, ...
  • Emamgholi, A., Zaefizadeh, M. &Imani, A. (2015). The proteomic analysis ...
  • Ershad, J. (1995). Fungi of Iran. Agricultural Research, Education and Extension Organization ...
  • Evanno, G., Regnaut, S. & Goudet, J. (2005). Detecting the ...
  • Food and Agriculture Organization. (2016). FAOSTAT, Crop production. Retrieved September 15, ...
  • Falush, D., Stephens, M. & Pritchard, J. K. (2003). Inference ...
  • Fusari, C. M., Di-Rienzo, J. A., Troglia, C., Nishinakamasu, V., ...
  • Gentzbittel, L., Mouzeyar, S., Badaoui, S., Mestries, E., Vear, F., ...
  • Ghavami, F., Elias, E. E., Mamidi, O., Ansari, M., Sargolzaei, ...
  • Gilmore, B., Myers, J. R. & Kean, D. (2002). Completion ...
  • Godoy, M., Castano, F., Re, J. & Rodriguez, R. (2005). ...
  • Hahn, V. (2002). Genetic variation for resistance to Sclerotinia head ...
  • Hartman, G. L., Gardner, M. E., Hymowitz, T. & Naidoo, ...
  • Hittalmani, S., Huang, N., Courtois, B., Venuprasad, R., Shashidhar, H. ...
  • Jannatdoust, M., Darvishzadeh, R., Ziaeifard, R., Azizi, H. & Gholinezhad, ...
  • Jun, T. H., Van, K., Kim, M. Y., Lee, S. ...
  • Lander, E. S. & Botstein, D. (1989). Mapping Mendelian factors ...
  • Liu, L., Wang, L., Yao, J., Zheng, Y. & Zhao, ...
  • Mestries, E., Gentzbittel, L., Tourvieille de Labrouhe, D., Nicolas, P. ...
  • Micic, Z., Hahn, V., Bauer, E., Scho¨ n, C.C., Knapp, ...
  • Micic, Z., Hahn, V., Bauer, E., Schon, C. C. & ...
  • Micic, Z., Hahn, V., Bauer, E., Melchinger, A.  E., Knapp, ...
  • Neale, D. B. & Savolainen, O. (2004). Association genetic of ...
  • in Plant Science, 9, 325-330. ...
  • Paniego, N., Heinz, R., Fernandez, P., Talia, P., Nishinakamasu, V. ...
  • Poormohammad-Kiani, S., Nouri, L., Maury, P., Darvishzadeh, R., Grieu P. ...
  • Porter, L. D., Hoheisel, G. & Coffman, V. A. (2009). ...
  • Price, K. & Colhoun, J. (1975). A study of variability ...
  • Pritchard, J. K., Stephens, M. N., Rosenberg, N. & Donnelly, ...
  • Pritchard, J. K. & Donnelly, P. (2001). Casecontrol studies of ...
  • Rönicke, S., Hahn, V., Vogler, A. & Friedt W. (2005). ...
  • Rostok, N., Ramsay, L., MacKenzie, K., Cardle, L. & Bhat, ...
  • Roy, J. K., Bandopadhyay, R., Rustgi, S., Balyan, H. S. ...
  • Saeed, A., Darvishzadeh, R. & Basirnia, B. (2013). Simple sequence ...
  • Saeed, M., Wangzhen, G. & Tianzhen, Z. (2014). Association mapping ...
  • Saharan, G. S. & Mehta, N. (2008). Economic importance, sclerotinia ...
  • Sahranavard Azartamar, F., Darvishzadeh, R., Ghadimzadeh, M., Azizi, H. & ...
  • Spataro, G., Tiranti, B., Arcaleni, P., Bellucci, E., Attene, G., ...
  • Talukder, Z. I., Hulke, B. S., Qi, L., Scheffler, B. ...
  • Tang, S., Yu, J. K., Slabaugh, M. B., Shintani, D. ...
  • Tuberosa, R., Salvi, S., Sanguineti, M. C., Landi, P., Maccaferri, ...
  • Yu, J. M. & Buckler, E. S. (2006). Genetic association ...
  • Yue, B., Radi, S. A., Vick, B. A., Cai, X., ...
  • Wang, M., Jiang, N., Jia, T., Leach, L., Cockram, J., ...
  • Zhang, Q., Wu, C., Ren, F. Y. & Zhang, C. ...
  • نمایش کامل مراجع