ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی miRNA ها و ژن های هدف مرتبط با آنها در گیاه خشخاش ( Papaver somniferum)

Publish place: IRANIAN JOURNAL OF FIELD CROP SCIENCE، Vol: 48، Issue: 4
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 445

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:
https://civilica.com/doc/888149

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJFCS-48-4_021

تاریخ نمایه سازی: 15 تیر 1398

Abstract:

miRNA ها یک رده از RNA های تنظیم کننده کوچک درون هسته ای و غیرکدکننده پروتئینی که متشکل از حدود 17-22 نوکلئوتید می باشند. miRNA ها بیان ژن را پس از رونویسی از طریق تجزیه mRNA یا مهار ترجمه انها کنترل کرده و نقش های متنوعی را در فرایند های بیولوژیکی و متابولیکی در گیاهان و جانوران بازی می کنند. روش های متعددی برای شناسایی miRNA ها موجود می باشد که یکی از ساده ترین و کم هزینه ترین انها ، روش شناسایی بیوانفورماتیکی می باشد. در این مطالعه با هدف شناسایی miRNA متمایز در گیاه خشخاش، مطالعه ای مبتنی بر جستجوی همولوژی بین EST های گیاه خشخاش و miRNA ها انجام گرفت. بطوریکه ابتدا همه توالی های EST های گیاه خشخاش از بانک اطلاعاتی NCBI در برابر miRNA های شناخته شده BLASTn شدند و در نهایت هفت miRNA کاندید متمایز در گیاه خشخاش شناسایی شد. ژن های هدف شناسایی شده با استفاده از نرم افزارهای مختلف مورد بررسی قرار گرفتند و مشخص گردید که miRNA های کاندید مرتبط با ژن های رمزکننده سرین/ ترئونین کیناز (انتقال سیگنال)، پروتئین های PPR (ویرایش و پایداری RNA )، گلوبولین های7S ( هیدراسیون و دهیدراسیون سلول)، فتوتروپین ها (پاسخ های نورگرایی)، پروتئین های سرین/ ترئونین فسفاتاز (متابولیسم گلیکوژن) و پروتئین های خانواده TIR ( دفاع در برابر باکتریها) می باشد. این ژن ها نقش مهمی در رشد و نمو ، متابولیسم ، تعیین مورفولوژی و زمان گلدهی و پاسخ به استرس های زنده و غیر زنده را بازی می کنند.

Keywords:

Authors

علی اکبر کریمی

دانشگاه تهران

محمدرضا نقوی

دانشگاه تهران

جابر نصیری

دانشگاه تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Akana, J., Fedorov, A. A., Fedorov, E., Novak, W.R., Babbitt, ...
  • Altschul, S.F., Madden, T.L., Schaffer, A.A., Zhang, J., Zhang, Z., ...
  • Barratt, D.P., Derbyshire, P., Findlay, K., Pike, M., Wellner, N., ...
  • Beam, C. E., Saveson, C. J. & Lovett, S. T. ...
  • Bertini, I. (2007). Biological inorganic chemistry: structure and reactivity. University Science ...
  • Bonnet, E., Wuyts, J., Rouze, P. & Peer, Y.V. (2004). ...
  • Mitcham, J. L., Parnet, P., Bonnert, T. P., Garka, K. ...
  • Dai, X., Zhao, P.X. (2011). PsRNATarget: a plant small RNA ...
  • DiDonato, R. J., Arbuckle, E., Buker, S., Sheets, J., Tobar, ...
  • Hagel, J. M. & Facchini, P. J. (2013). Benzylisoquinoline alkaloid ...
  • Hagen, G. & Guilfoyle, T. (2002). Auxin-responsive gene expression: genes, ...
  • He, G. H., Helbing, C. C., Wagner, M. J., Sensen, ...
  • Jin, J. B., Kim, Y. A., Kim, S. J., Lee, ...
  • Lamb, D. C., Lei, L., Warrilow, A. G., Lepesheva, G. ...
  • Li, C. & Zhang, B. (2016). MicroRNAs in control of ...
  • Lin, S. L., Chang, D. & Ying, S. Y. (2005). ...
  • Manna, S. (2015). An overview of pentatricopeptide repeat proteins and ...
  • Müntz, K. (1998). Globulins from legume seeds: Structure and function ...
  • Park, W., Li, J., Song, R., Messing, J. & Chen, ...
  • Qiu, X. B., Shao, Y. M., Miao, S. & Wang, ...
  • Sedlacek, Z., Munstermann, E., Mincheva, A., Lichter, P. & Poustka, ...
  • Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M., ...
  • Unver, T., Budak, H. (2009) Conserved microRNAs and their targets ...
  • Vincent, S. & Settleman, J. (1997). The PRK2 kinase is ...
  • Wiemer, E. A. (2007). The role of microRNAs in cancer: ...
  • Yin, Z., Li, C., Han, X. & Shen, F. (2008). ...
  • Wera, S. & Hemmings, B. A. (1995). Serine/threonine protein phosphatases. Biochemical ...
  • Zhang, Y. (2005). miRU: an automated  plant miRNA target  prediction ...
  • Zhang, B., Pan, X., Cobb, G. P. & Anderson, T. ...
  • Zhang, B., Pan, X., Wang, Q., Cobb, G. P. & ...
  • Zhang, B.H., Pan, X.P., Cox, S.B., Cobb, G.P., Anderson, T.A. ...
  • Zhang, B., Pan, X., Cannon, C. H., Cobb, G. P. ...
  • Zhang, B., Wang, Q., Wang, K., Pan, X., Liu, F., ...
  • Zhang, B., Pan, X. & Stellwag, E. J. (2008). Identification ...
  • Zhang, W., Luo, Y., Gong, X., Zeng, W., Li, S. ...
  • Zuker, M. (2003) Mfold web server for nucleic acid folding ...
    • نمایش کامل مراجع