ارزیابی بیوانفورماتیکی روابط فیلوژنتیکی ومولکولی ژن پیروات دهیدروژناز دریوکاریوت ها

آنزیم پیروات دهیدروژناز یکی از مهمترین آنزیم های چرخه اسید سیتریک است که پیرووات را به استیل کوآ تبدیل می سازد. در بررسی حاضر به منظور آگاهی از روند تکاملی و مولکولی ژن پیرووات دهیدروژناز در یوکاریوت ها، آنالیز فیلوژنی و روند انتخاب طبیعی در طی تکامل صورت پذیرفت. از سایت https://web.expasy.org/protparam برای بدست آوردن خواص فیزیکوشیمیایی و از سایت http://www.biogem.org/tool برای آنالیز ساختار دوم پروتئین ها استفاده شد. برای بررسی روابط تکاملی و رسم درخت فیلوژنتیکی و همچنین فاصله ژنتیکی 11 توالی پروتئینی ژن پیرووات دهیدروژناز از نرم افزار Mega6 به همراه bootstrap استفاده شد. توالی ژنی پیرووات دهیدروژناز در یوکاریوت ها که هرکدام یک نسخه از توالی ژن را دارا بودند از بانک اطلاعاتی ژنوم (NCBI) بدست آمده و هم ردیف شدند. درخت فیلوژنی برای ژن مذکور نشان می دهدکه به طور کلی پروتین پیرووات دهیدروژناز در 11 گونه یوکاریوت مختلف مورد بررسی، براساس مسیر تکاملی خود به سه کلاستر مجزا تقسیم می شوند. که گونه Homo sapiens با درصد تفاوت بیشتر از سایر گونه ها دریک کلاستر جداگانه قرار گرفته است. در کلاستر دیگر دوگونه Pteropus alecto و Pteropus vampyrus بیشترین شباهت را نشان دادند . که گونه Homo sapiens بیشترین فاصله ژنتیکی را نسبت به سایر گونه های مورد بررسی نشان داد.

Keywords:

پیرووات دهیدروژناز , فیلوژنی , یوکاریوت ها