طراحی پرایمر اختصاصی ردیابی ژنوتیپ QX ویروس برونشیت عفونی پرندگان

تحقیق حاضر به منظور طراحی آغازگر اختصاصی ردیابی ژنوتیپ QX ویروس برونشیت عفونی پرندگان انجام گرفت. استخراج توالی ژنS1 ویروس QX از بانک جهانی ژن انجام گرفت. بر اساس خروجی همردیفی ناشی از سویه های QX، ماساچوست، واریانت 2 و B/793 ناحیه های اختصاصی برای QX توسط نرم افزار بیوانفورماتیکی CLC شناسایی شدند؛ و پرایمر آن طراحی و ساخته شد. استخراج RNA ویروسی با استفاده از کیت Cinna Pure RNA (شرکت سیناکلون- ایران) انجام شد. پرایمر طراحی شده اختصاصا قادر به شناسایی واریانت QX بوده و نمونه های دیگر که سایر واریانتهای برونشیت بود نتیجه منفی داشته و به وسیله پرایمر مورد بررسی، قابل شناسایی نبوده است. طول باند به دست آمده 660 جفت باز بود. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که میتوان از آغازگر طراحی شده جهت شناسایی و پیشبینی وجود واریانت QX برونشیت عفونی پرندگان در گله های مرغ گوشتی به روش RT-PCR استفاده نمود.

Keywords:

طراحی پرایمر , ارزیابی RT-PCR , ردیابی ژنوتیپ QX , برونشیت عفونی , پرندگان