Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
عنوان
Paper

High throughput deep sequencing revealed different molecular mechanisms in cereals are mediated by miRNAs

تعداد صفحات: 1 | تعداد نمایش خلاصه: 120 | نظرات: 0
سال انتشار: 1397
کد COI Paper: IBIS08_046
زبان Paper: Englishglish
نسخه کامل Paper در کنفرانس ارائه نشده است و در دسترس نیست.

مشخصات نویسندگان Paper High throughput deep sequencing revealed different molecular mechanisms in cereals are mediated by miRNAs

بهنام بخشی - 1بخش تحقیقات زراعی و باغی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی سیستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، زابل، ایران
احسان محسنی فرد - 2گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان
قاسم حسینی سالکده - 3گروه زیست شناسی سامانه ها، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
محمدرضا بی همتا - 4گروه اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

چکیده Paper:

In the current study cereal (including wheat, barley and rice) miRNAs have been investigated using small RNA extraction, high throughput deep sequencing and bioinformatics analysis. In this study 28175274, 28404511 and 27515162 miRNA reads have been observed for wheat, barley and rice, respectively. 53%, 60% and 76% of these reads were matched with their genomes, respectively.1814 reads of known miRNAs and 105 reads of novel miRNAs have been identified for wheat. Likewise, 782 reads of known miRNAs and 131 reads of novel miRNAs have been explored for barley. Furthermore, 338 reads of known miRNAs and 31 reads of novel miRNAs have been recognized for barley. MiR156 and Novel_1290 (in wheat), miR168 and Novel_1290 (in barley) and miR166 and Novel_1290 (in rice) were the most frequent miRNAs in the investigated cereals. Thus different frequent miRNAs are involved in cereals. Furthermore, differential expression of cereal miRNAs has been observed for many of expressed miRNAs. Additionally, target prediction and gene ontology analysis indicated that although some of miRNAs are involved in same pathways among cereals but could regulate them through another ways that could led to different molecular mechanisms through differentially expressed miRNAs.

کلیدواژه ها:

microRNAs, Next Generation sequencing, Wheat, Barley, Rice

کد Paper/لینک ثابت به این Paper

برای لینک دهی به این Paper می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت Paper در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/908709/

کد COI Paper: IBIS08_046

نحوه استناد به Paper:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این Paper ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
undefined, undefined و undefined, undefined و undefined, undefined و undefined, undefined,1397,High throughput deep sequencing revealed different molecular mechanisms in cereals are mediated by miRNAs,هشتمین همایش بیوانفورماتیک ایران,Zabol,,,https://civilica.com/doc/908709

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این Paper اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1397, بخشی, بهنام؛ احسان محسنی فرد و قاسم حسینی سالکده و محمدرضا بی همتا)
برای بار دوم به بعد: (1397, بخشی؛ محسنی فرد و حسینی سالکده و بی همتا)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

Research Info Management

Certificate | Report Paper

Export Citation info of this Paper to research management softwares

علم سنجی و رتبه بندی Paper

مشخصات مرکز تولید کننده این Paper به صورت زیر است:
نوع مرکز: سازمان تحقیقات کشاورزی
تعداد مقالات: 190
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

New RelatedPapers

Share this paper

WHAT IS COI?

COI is a national code dedicated to all Iranian Conference and Journal Papers. the COI of each paper can be verified online.

Support